Occurrence

Chironomid Specimen records in the Chironomid DNA Barcode Database.

Последняя версия опубликована National Institute of Genetics, ROIS 21 февраля 2024 г. National Institute of Genetics, ROIS
Домой:
Ссылка
Дата публикации:
21 февраля 2024 г.
Опубликовано:
National Institute of Genetics, ROIS
Лицензия:
CC-BY 4.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 917 Записи в English (118 KB) - Частота обновления: annually
Метаданные в формате EML Скачать в English (40 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (11 KB)

Описание

This dataset contains 917 specimen records of 179 chironomid species between 1989 and 2015 in Japan, which are based on the Chironomid DNA Barcode Database published by National Institute for Environmental Studies, Japan (NIES). The Chironomid DNA Barcode Database can be found at https://www.nies.go.jp/yusurika/en/index.html.

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 917 записей.

Также в наличии 2 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

Occurrence (core)
917
dnaDerivedData 
917
Multimedia 
499

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

National Institute for Environmental Studies (2021) Chironomid Specimen records in the Chironomid DNA Barcode Database. 917 records, Contributed by Takamura K, Ueno R, Kondo N, Online:http://www.gbif.jp/ipt/archive.do?r=nies_cdbd, under CC BY 4.0, released on 08/04/2021.

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является National Institute of Genetics, ROIS. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 02cc981e-d1d8-4ea6-9db5-dfb73acca024.  National Institute of Genetics, ROIS отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке GBIF Japan.

Ключевые слова

Occurrence; Specimen; Chironomid; DNA barcoding; DNA barcode; Occurrence

Контакты

Kenzi Takamura
  • Content Provider
  • Metadata Provider
  • Originator
Visiting researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Ryuhei Ueno
  • Content Provider
  • Originator
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
+8129-850-2408
Natsuko I. Kondo
  • Content Provider
  • Originator
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
+8129-850-2860
Kimio Hirabayashi
  • Content Provider
  • Originator
Professor
Shinshu University
JP
Koichiro Kawai
  • Content Provider
  • Originator
Professor
Hiroshima University
JP
Biodiversity Division
  • Point Of Contact
National Institute for Environmental Studies
Kumiko Totsu
  • Programmer
Specialist (Database engineer)
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
+8129-850-2894

Географический охват

Japan

Ограничивающие координаты Юг Запад [24,274, 123,757], Север Восток [45,441, 144,213]

Таксономический охват

Описание отсутсвует

Genus Ablabesmyia, Ainuyusurika, Benthalia, Biwatendipes, Brillia, Bryophaenocladius, Cardiocladius, Chironomus, Cladopelma, Cladotanytarsus, Compterosmittia, Conchapelopia, Corynoneura, Cricotopus, Cryptochironomus, Demicryptochironomus, Diamesa, Dicrotendipes, Endochironomus, Eukiefferiella, Euryhapsis, Glyptotendipes, Harnischia, Heleniella, Heterotrissocladius, Kiefferulus, Limnophyes, Lipiniella, Metriocnemus, Microchironomus, Micropsectra, Microtendipes, Nanocladius, Neozavrelia, Nilodorum, Nilotanypus, Nilothauma, Orthocladius, Parachironomus, Paracladopelma, Parakiefferiella, Paramerina, Parametriocnemus, Paraphaenocladius, Paratanytarsus, Paratendipes, Polypedilum, Potthastia, Procladius, Prodiamesa, Propsilocerus, Psectrocladius, Psectrotanypus, Pseudorthocladius, Rheocricotopus, Rheopelopia, Rheotanytarsus, Smittia, Stempellinella, Stenochironomus, Stictochironomus, Synorthocladius, Tanypus, Tanytarsus, Telmatogeton, Thienemanniella, Thienemannimyia, Trissopelopia, Tvetenia, Virgatanytarsus, Yaetanytarsus

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 1989-01-01 / 2015-10-11

Данные проекта

This dataset contains 917 specimen records of 179 chironomid species between 1989 and 2015 in Japan, which are based on the Chironomid DNA Barcode Database published by National Institute for Environmental Studies, Japan (NIES). The Chironomid DNA Barcode Database can be found at https://www.nies.go.jp/yusurika/en/index.html.

Название Diversity and water quality index of insects of the family Chironomidae investigated with DNA barcoding
Финансирование Grant Number 24241078, Grants-in-Aid for Scientific Research (KAKENHI), Japan Society for the Promotion of Science.

Исполнители проекта:

Kenzi Takamura
  • Content Provider

Методы сбора

Specimens were collected in three major ways. (1) Larvae and pupae in bottom sediments were captured with a Ekman bottom grab sampler or a dip net in lentic waters and with a Surber sampler or a D-frame net in lotic waters. Aquatic weeds were also hand-collected for periphytic species. (2) A part of chironomids captured underwater was reared to adults in the laboratory. They were kept in water aerated with a pump in tanks. (3) Midges were collected with an emergence trap or a sweeping net on and around waters where they emerged.

Охват исследования Chironomid species were captured in Japan and Tuvalu from 1989 to 2015.
Контроль качества Scientific names were validated against the Catalogue of the Insects of Japan Vol.8 (Yamamoto and Yamamoto 2014) and the GBIF Backbone Taxonomy.

Описание этапа методики:

  1. Morphological identification was used to determine the species names of specimens, along with DNA barcoding and ecological observations for a limited number of species. Geographic coordinates and uncertainties were measured using gazetteers such as Google Maps following procedures described in Chapman and Wieczorek (2006). Chironomid specimen records were extracted from the Chironomid DNA Barcode Database and organized into species occurrence data using a MySQL database.

Библиографические ссылки

  1. Chapman, A.D. and Wieczorek, J. (Eds) (2006) Guide to Best Practices for Georeferencing. Global Biodiversity Information Facility, Copenhagen, 90 pp.
  2. Yamamoto, M. and Yamamoto, N. (2014) Family Chironomidae. In: Editorial Committee of Catalogue of the Insects of Japan (ed.): Catalogue of the Insects of Japan Vol.8 Diptera. Part 1: Nematocera-Brachycera Aschiza, Touka Shobo, Fukuoka, Japan, pp. 237-362.

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы 02cc981e-d1d8-4ea6-9db5-dfb73acca024
https://gbif.jp/ipt/resource?r=nies_cdbd