Chironomid Specimen records in the Chironomid DNA Barcode Database.

Registros biológicos
Última versión publicado por National Institute of Genetics, ROIS el feb 21, 2024 National Institute of Genetics, ROIS

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Descripción

This dataset contains 917 specimen records of 179 chironomid species between 1989 and 2015 in Japan, which are based on the Chironomid DNA Barcode Database published by National Institute for Environmental Studies, Japan (NIES). The Chironomid DNA Barcode Database can be found at https://www.nies.go.jp/yusurika/en/index.html.

Registros

Los datos en este recurso de registros biológicos han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 917 registros.

también existen 2 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

Occurrence (core)
917
dnaDerivedData 
917
Multimedia 
499

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

National Institute for Environmental Studies (2021) Chironomid Specimen records in the Chironomid DNA Barcode Database. 917 records, Contributed by Takamura K, Ueno R, Kondo N, Online:http://www.gbif.jp/ipt/archive.do?r=nies_cdbd, under CC BY 4.0, released on 08/04/2021.

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es National Institute of Genetics, ROIS. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 02cc981e-d1d8-4ea6-9db5-dfb73acca024.  National Institute of Genetics, ROIS publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por GBIF Japan.

Palabras clave

Occurrence; Specimen; Chironomid; DNA barcoding; DNA barcode; Occurrence

Contactos

Kenzi Takamura
  • Proveedor De Contenido
  • Proveedor De Los Metadatos
  • Originador
Visiting researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Ryuhei Ueno
  • Proveedor De Contenido
  • Originador
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
+8129-850-2408
Natsuko I. Kondo
  • Proveedor De Contenido
  • Originador
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
+8129-850-2860
Kimio Hirabayashi
  • Proveedor De Contenido
  • Originador
Professor
Shinshu University
JP
Koichiro Kawai
  • Proveedor De Contenido
  • Originador
Professor
Hiroshima University
JP
Biodiversity Division
  • Punto De Contacto
National Institute for Environmental Studies
Kumiko Totsu
  • Programador
Specialist (Database engineer)
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
+8129-850-2894

Cobertura geográfica

Japan

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [24,274, 123,757], Latitud Máxima Longitud Máxima [45,441, 144,213]

Cobertura taxonómica

No hay descripción disponible

Género Ablabesmyia, Ainuyusurika, Benthalia, Biwatendipes, Brillia, Bryophaenocladius, Cardiocladius, Chironomus, Cladopelma, Cladotanytarsus, Compterosmittia, Conchapelopia, Corynoneura, Cricotopus, Cryptochironomus, Demicryptochironomus, Diamesa, Dicrotendipes, Endochironomus, Eukiefferiella, Euryhapsis, Glyptotendipes, Harnischia, Heleniella, Heterotrissocladius, Kiefferulus, Limnophyes, Lipiniella, Metriocnemus, Microchironomus, Micropsectra, Microtendipes, Nanocladius, Neozavrelia, Nilodorum, Nilotanypus, Nilothauma, Orthocladius, Parachironomus, Paracladopelma, Parakiefferiella, Paramerina, Parametriocnemus, Paraphaenocladius, Paratanytarsus, Paratendipes, Polypedilum, Potthastia, Procladius, Prodiamesa, Propsilocerus, Psectrocladius, Psectrotanypus, Pseudorthocladius, Rheocricotopus, Rheopelopia, Rheotanytarsus, Smittia, Stempellinella, Stenochironomus, Stictochironomus, Synorthocladius, Tanypus, Tanytarsus, Telmatogeton, Thienemanniella, Thienemannimyia, Trissopelopia, Tvetenia, Virgatanytarsus, Yaetanytarsus

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 1989-01-01 / 2015-10-11

Datos del proyecto

This dataset contains 917 specimen records of 179 chironomid species between 1989 and 2015 in Japan, which are based on the Chironomid DNA Barcode Database published by National Institute for Environmental Studies, Japan (NIES). The Chironomid DNA Barcode Database can be found at https://www.nies.go.jp/yusurika/en/index.html.

Título Diversity and water quality index of insects of the family Chironomidae investigated with DNA barcoding
Fuentes de Financiación Grant Number 24241078, Grants-in-Aid for Scientific Research (KAKENHI), Japan Society for the Promotion of Science.

Personas asociadas al proyecto:

Kenzi Takamura
  • Proveedor De Contenido

Métodos de muestreo

Specimens were collected in three major ways. (1) Larvae and pupae in bottom sediments were captured with a Ekman bottom grab sampler or a dip net in lentic waters and with a Surber sampler or a D-frame net in lotic waters. Aquatic weeds were also hand-collected for periphytic species. (2) A part of chironomids captured underwater was reared to adults in the laboratory. They were kept in water aerated with a pump in tanks. (3) Midges were collected with an emergence trap or a sweeping net on and around waters where they emerged.

Área de Estudio Chironomid species were captured in Japan and Tuvalu from 1989 to 2015.
Control de Calidad Scientific names were validated against the Catalogue of the Insects of Japan Vol.8 (Yamamoto and Yamamoto 2014) and the GBIF Backbone Taxonomy.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. Morphological identification was used to determine the species names of specimens, along with DNA barcoding and ecological observations for a limited number of species. Geographic coordinates and uncertainties were measured using gazetteers such as Google Maps following procedures described in Chapman and Wieczorek (2006). Chironomid specimen records were extracted from the Chironomid DNA Barcode Database and organized into species occurrence data using a MySQL database.

Referencias bibliográficas

  1. Chapman, A.D. and Wieczorek, J. (Eds) (2006) Guide to Best Practices for Georeferencing. Global Biodiversity Information Facility, Copenhagen, 90 pp.
  2. Yamamoto, M. and Yamamoto, N. (2014) Family Chironomidae. In: Editorial Committee of Catalogue of the Insects of Japan (ed.): Catalogue of the Insects of Japan Vol.8 Diptera. Part 1: Nematocera-Brachycera Aschiza, Touka Shobo, Fukuoka, Japan, pp. 237-362.

Metadatos adicionales

Identificadores alternativos 02cc981e-d1d8-4ea6-9db5-dfb73acca024
https://gbif.jp/ipt/resource?r=nies_cdbd