Chironomid Specimen records in the Chironomid DNA Barcode Database.

Occurrence
Dernière version Publié par National Institute of Genetics, ROIS le févr. 21, 2024 National Institute of Genetics, ROIS

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Description

This dataset contains 917 specimen records of 179 chironomid species between 1989 and 2015 in Japan, which are based on the Chironomid DNA Barcode Database published by National Institute for Environmental Studies, Japan (NIES). The Chironomid DNA Barcode Database can be found at https://www.nies.go.jp/yusurika/en/index.html.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 917 enregistrements.

2 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

Occurrence (noyau)
917
dnaDerivedData 
917
Multimedia 
499

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

National Institute for Environmental Studies (2021) Chironomid Specimen records in the Chironomid DNA Barcode Database. 917 records, Contributed by Takamura K, Ueno R, Kondo N, Online:http://www.gbif.jp/ipt/archive.do?r=nies_cdbd, under CC BY 4.0, released on 08/04/2021.

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est National Institute of Genetics, ROIS. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 02cc981e-d1d8-4ea6-9db5-dfb73acca024.  National Institute of Genetics, ROIS publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du GBIF Japan.

Mots-clé

Occurrence; Specimen; Chironomid; DNA barcoding; DNA barcode; Occurrence

Contacts

Kenzi Takamura
  • Fournisseur De Contenu
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Créateur
Visiting researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Ryuhei Ueno
  • Fournisseur De Contenu
  • Créateur
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
+8129-850-2408
Natsuko I. Kondo
  • Fournisseur De Contenu
  • Créateur
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
+8129-850-2860
Kimio Hirabayashi
  • Fournisseur De Contenu
  • Créateur
Professor
Shinshu University
JP
Koichiro Kawai
  • Fournisseur De Contenu
  • Créateur
Professor
Hiroshima University
JP
Biodiversity Division
  • Personne De Contact
National Institute for Environmental Studies
Kumiko Totsu
  • Programmeur
Specialist (Database engineer)
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
+8129-850-2894

Couverture géographique

Japan

Enveloppe géographique Sud Ouest [24,274, 123,757], Nord Est [45,441, 144,213]

Couverture taxonomique

Pas de description disponible

Genus Ablabesmyia, Ainuyusurika, Benthalia, Biwatendipes, Brillia, Bryophaenocladius, Cardiocladius, Chironomus, Cladopelma, Cladotanytarsus, Compterosmittia, Conchapelopia, Corynoneura, Cricotopus, Cryptochironomus, Demicryptochironomus, Diamesa, Dicrotendipes, Endochironomus, Eukiefferiella, Euryhapsis, Glyptotendipes, Harnischia, Heleniella, Heterotrissocladius, Kiefferulus, Limnophyes, Lipiniella, Metriocnemus, Microchironomus, Micropsectra, Microtendipes, Nanocladius, Neozavrelia, Nilodorum, Nilotanypus, Nilothauma, Orthocladius, Parachironomus, Paracladopelma, Parakiefferiella, Paramerina, Parametriocnemus, Paraphaenocladius, Paratanytarsus, Paratendipes, Polypedilum, Potthastia, Procladius, Prodiamesa, Propsilocerus, Psectrocladius, Psectrotanypus, Pseudorthocladius, Rheocricotopus, Rheopelopia, Rheotanytarsus, Smittia, Stempellinella, Stenochironomus, Stictochironomus, Synorthocladius, Tanypus, Tanytarsus, Telmatogeton, Thienemanniella, Thienemannimyia, Trissopelopia, Tvetenia, Virgatanytarsus, Yaetanytarsus

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 1989-01-01 / 2015-10-11

Données sur le projet

This dataset contains 917 specimen records of 179 chironomid species between 1989 and 2015 in Japan, which are based on the Chironomid DNA Barcode Database published by National Institute for Environmental Studies, Japan (NIES). The Chironomid DNA Barcode Database can be found at https://www.nies.go.jp/yusurika/en/index.html.

Titre Diversity and water quality index of insects of the family Chironomidae investigated with DNA barcoding
Financement Grant Number 24241078, Grants-in-Aid for Scientific Research (KAKENHI), Japan Society for the Promotion of Science.

Les personnes impliquées dans le projet:

Kenzi Takamura
  • Fournisseur De Contenu

Méthodes d'échantillonnage

Specimens were collected in three major ways. (1) Larvae and pupae in bottom sediments were captured with a Ekman bottom grab sampler or a dip net in lentic waters and with a Surber sampler or a D-frame net in lotic waters. Aquatic weeds were also hand-collected for periphytic species. (2) A part of chironomids captured underwater was reared to adults in the laboratory. They were kept in water aerated with a pump in tanks. (3) Midges were collected with an emergence trap or a sweeping net on and around waters where they emerged.

Etendue de l'étude Chironomid species were captured in Japan and Tuvalu from 1989 to 2015.
Contrôle qualité Scientific names were validated against the Catalogue of the Insects of Japan Vol.8 (Yamamoto and Yamamoto 2014) and the GBIF Backbone Taxonomy.

Description des étapes de la méthode:

  1. Morphological identification was used to determine the species names of specimens, along with DNA barcoding and ecological observations for a limited number of species. Geographic coordinates and uncertainties were measured using gazetteers such as Google Maps following procedures described in Chapman and Wieczorek (2006). Chironomid specimen records were extracted from the Chironomid DNA Barcode Database and organized into species occurrence data using a MySQL database.

Citations bibliographiques

  1. Chapman, A.D. and Wieczorek, J. (Eds) (2006) Guide to Best Practices for Georeferencing. Global Biodiversity Information Facility, Copenhagen, 90 pp.
  2. Yamamoto, M. and Yamamoto, N. (2014) Family Chironomidae. In: Editorial Committee of Catalogue of the Insects of Japan (ed.): Catalogue of the Insects of Japan Vol.8 Diptera. Part 1: Nematocera-Brachycera Aschiza, Touka Shobo, Fukuoka, Japan, pp. 237-362.

Métadonnées additionnelles

Identifiants alternatifs 02cc981e-d1d8-4ea6-9db5-dfb73acca024
https://gbif.jp/ipt/resource?r=nies_cdbd