Chironomid Specimen records in the Chironomid DNA Barcode Database.

オカレンス(観察データと標本)
最新バージョン National Institute of Genetics, ROIS により出版 2月 21, 2024 National Institute of Genetics, ROIS

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説明

This dataset contains 917 specimen records of 179 chironomid species between 1989 and 2015 in Japan, which are based on the Chironomid DNA Barcode Database published by National Institute for Environmental Studies, Japan (NIES). The Chironomid DNA Barcode Database can be found at https://www.nies.go.jp/yusurika/en/index.html.

データ レコード

この オカレンス(観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、917 レコードが含まれています。

拡張データ テーブルは2 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

Occurrence (コア)
917
dnaDerivedData 
917
Multimedia 
499

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

National Institute for Environmental Studies (2021) Chironomid Specimen records in the Chironomid DNA Barcode Database. 917 records, Contributed by Takamura K, Ueno R, Kondo N, Online:http://www.gbif.jp/ipt/archive.do?r=nies_cdbd, under CC BY 4.0, released on 08/04/2021.

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は National Institute of Genetics, ROIS。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 02cc981e-d1d8-4ea6-9db5-dfb73acca024が割り当てられています。   GBIF Japan によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているNational Institute of Genetics, ROIS が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Occurrence; Specimen; Chironomid; DNA barcoding; DNA barcode; Occurrence

連絡先

Kenzi Takamura
  • データ提供者
  • メタデータ提供者
  • 最初のデータ採集者
Visiting researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Ryuhei Ueno
  • データ提供者
  • 最初のデータ採集者
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
+8129-850-2408
Natsuko I. Kondo
  • データ提供者
  • 最初のデータ採集者
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
+8129-850-2860
Kimio Hirabayashi
  • データ提供者
  • 最初のデータ採集者
Professor
Shinshu University
JP
Koichiro Kawai
  • データ提供者
  • 最初のデータ採集者
Professor
Hiroshima University
JP
Biodiversity Division
  • 連絡先
National Institute for Environmental Studies
Kumiko Totsu
  • プログラマー
Specialist (Database engineer)
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
+8129-850-2894

地理的範囲

Japan

座標(緯度経度) 南 西 [24.274, 123.757], 北 東 [45.441, 144.213]

生物分類学的範囲

説明がありません

Genus Ablabesmyia, Ainuyusurika, Benthalia, Biwatendipes, Brillia, Bryophaenocladius, Cardiocladius, Chironomus, Cladopelma, Cladotanytarsus, Compterosmittia, Conchapelopia, Corynoneura, Cricotopus, Cryptochironomus, Demicryptochironomus, Diamesa, Dicrotendipes, Endochironomus, Eukiefferiella, Euryhapsis, Glyptotendipes, Harnischia, Heleniella, Heterotrissocladius, Kiefferulus, Limnophyes, Lipiniella, Metriocnemus, Microchironomus, Micropsectra, Microtendipes, Nanocladius, Neozavrelia, Nilodorum, Nilotanypus, Nilothauma, Orthocladius, Parachironomus, Paracladopelma, Parakiefferiella, Paramerina, Parametriocnemus, Paraphaenocladius, Paratanytarsus, Paratendipes, Polypedilum, Potthastia, Procladius, Prodiamesa, Propsilocerus, Psectrocladius, Psectrotanypus, Pseudorthocladius, Rheocricotopus, Rheopelopia, Rheotanytarsus, Smittia, Stempellinella, Stenochironomus, Stictochironomus, Synorthocladius, Tanypus, Tanytarsus, Telmatogeton, Thienemanniella, Thienemannimyia, Trissopelopia, Tvetenia, Virgatanytarsus, Yaetanytarsus

時間的範囲

開始日 / 終了日 1989-01-01 / 2015-10-11

プロジェクトデータ

This dataset contains 917 specimen records of 179 chironomid species between 1989 and 2015 in Japan, which are based on the Chironomid DNA Barcode Database published by National Institute for Environmental Studies, Japan (NIES). The Chironomid DNA Barcode Database can be found at https://www.nies.go.jp/yusurika/en/index.html.

タイトル Diversity and water quality index of insects of the family Chironomidae investigated with DNA barcoding
ファンデイング Grant Number 24241078, Grants-in-Aid for Scientific Research (KAKENHI), Japan Society for the Promotion of Science.

プロジェクトに携わる要員:

Kenzi Takamura
  • データ提供者

収集方法

Specimens were collected in three major ways. (1) Larvae and pupae in bottom sediments were captured with a Ekman bottom grab sampler or a dip net in lentic waters and with a Surber sampler or a D-frame net in lotic waters. Aquatic weeds were also hand-collected for periphytic species. (2) A part of chironomids captured underwater was reared to adults in the laboratory. They were kept in water aerated with a pump in tanks. (3) Midges were collected with an emergence trap or a sweeping net on and around waters where they emerged.

Study Extent Chironomid species were captured in Japan and Tuvalu from 1989 to 2015.
Quality Control Scientific names were validated against the Catalogue of the Insects of Japan Vol.8 (Yamamoto and Yamamoto 2014) and the GBIF Backbone Taxonomy.

Method step description:

  1. Morphological identification was used to determine the species names of specimens, along with DNA barcoding and ecological observations for a limited number of species. Geographic coordinates and uncertainties were measured using gazetteers such as Google Maps following procedures described in Chapman and Wieczorek (2006). Chironomid specimen records were extracted from the Chironomid DNA Barcode Database and organized into species occurrence data using a MySQL database.

書誌情報の引用

  1. Chapman, A.D. and Wieczorek, J. (Eds) (2006) Guide to Best Practices for Georeferencing. Global Biodiversity Information Facility, Copenhagen, 90 pp.
  2. Yamamoto, M. and Yamamoto, N. (2014) Family Chironomidae. In: Editorial Committee of Catalogue of the Insects of Japan (ed.): Catalogue of the Insects of Japan Vol.8 Diptera. Part 1: Nematocera-Brachycera Aschiza, Touka Shobo, Fukuoka, Japan, pp. 237-362.

追加のメタデータ

代替識別子 02cc981e-d1d8-4ea6-9db5-dfb73acca024
https://gbif.jp/ipt/resource?r=nies_cdbd