Ocorrência

Chironomid Specimen records in the Chironomid DNA Barcode Database.

Versão mais recente publicado por National Institute of Genetics, ROIS em 21 de Fevereiro de 2024 National Institute of Genetics, ROIS
Início:
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Publication date:
21 de Fevereiro de 2024
Licença:
CC-BY 4.0

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Descrição

This dataset contains 917 specimen records of 179 chironomid species between 1989 and 2015 in Japan, which are based on the Chironomid DNA Barcode Database published by National Institute for Environmental Studies, Japan (NIES). The Chironomid DNA Barcode Database can be found at https://www.nies.go.jp/yusurika/en/index.html.

Registros de Dados

Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 917 registros.

Também existem 2 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.

Occurrence (core)
917
dnaDerivedData 
917
Multimedia 
499

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Como citar

Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:

National Institute for Environmental Studies (2021) Chironomid Specimen records in the Chironomid DNA Barcode Database. 917 records, Contributed by Takamura K, Ueno R, Kondo N, Online:http://www.gbif.jp/ipt/archive.do?r=nies_cdbd, under CC BY 4.0, released on 08/04/2021.

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é National Institute of Genetics, ROIS. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF Registration

Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: 02cc981e-d1d8-4ea6-9db5-dfb73acca024.  National Institute of Genetics, ROIS publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por GBIF Japan.

Palavras-chave

Occurrence; Specimen; Chironomid; DNA barcoding; DNA barcode; Occurrence

Contatos

Kenzi Takamura
  • Provedor De Conteúdo
  • Provedor Dos Metadados
  • Originador
Visiting researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Ryuhei Ueno
  • Provedor De Conteúdo
  • Originador
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
+8129-850-2408
Natsuko I. Kondo
  • Provedor De Conteúdo
  • Originador
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
+8129-850-2860
Kimio Hirabayashi
  • Provedor De Conteúdo
  • Originador
Professor
Shinshu University
JP
Koichiro Kawai
  • Provedor De Conteúdo
  • Originador
Professor
Hiroshima University
JP
Biodiversity Division
  • Ponto De Contato
National Institute for Environmental Studies
Kumiko Totsu
  • Programador
Specialist (Database engineer)
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
+8129-850-2894

Cobertura Geográfica

Japan

Coordenadas delimitadoras Sul Oeste [24,274, 123,757], Norte Leste [45,441, 144,213]

Cobertura Taxonômica

Nenhuma descrição disponível

Gênero Ablabesmyia, Ainuyusurika, Benthalia, Biwatendipes, Brillia, Bryophaenocladius, Cardiocladius, Chironomus, Cladopelma, Cladotanytarsus, Compterosmittia, Conchapelopia, Corynoneura, Cricotopus, Cryptochironomus, Demicryptochironomus, Diamesa, Dicrotendipes, Endochironomus, Eukiefferiella, Euryhapsis, Glyptotendipes, Harnischia, Heleniella, Heterotrissocladius, Kiefferulus, Limnophyes, Lipiniella, Metriocnemus, Microchironomus, Micropsectra, Microtendipes, Nanocladius, Neozavrelia, Nilodorum, Nilotanypus, Nilothauma, Orthocladius, Parachironomus, Paracladopelma, Parakiefferiella, Paramerina, Parametriocnemus, Paraphaenocladius, Paratanytarsus, Paratendipes, Polypedilum, Potthastia, Procladius, Prodiamesa, Propsilocerus, Psectrocladius, Psectrotanypus, Pseudorthocladius, Rheocricotopus, Rheopelopia, Rheotanytarsus, Smittia, Stempellinella, Stenochironomus, Stictochironomus, Synorthocladius, Tanypus, Tanytarsus, Telmatogeton, Thienemanniella, Thienemannimyia, Trissopelopia, Tvetenia, Virgatanytarsus, Yaetanytarsus

Cobertura Temporal

Data Inicial / Data final 1989-01-01 / 2015-10-11

Dados Sobre o Projeto

This dataset contains 917 specimen records of 179 chironomid species between 1989 and 2015 in Japan, which are based on the Chironomid DNA Barcode Database published by National Institute for Environmental Studies, Japan (NIES). The Chironomid DNA Barcode Database can be found at https://www.nies.go.jp/yusurika/en/index.html.

Título Diversity and water quality index of insects of the family Chironomidae investigated with DNA barcoding
Financiamento Grant Number 24241078, Grants-in-Aid for Scientific Research (KAKENHI), Japan Society for the Promotion of Science.

O pessoal envolvido no projeto:

Kenzi Takamura
  • Provedor De Conteúdo

Métodos de Amostragem

Specimens were collected in three major ways. (1) Larvae and pupae in bottom sediments were captured with a Ekman bottom grab sampler or a dip net in lentic waters and with a Surber sampler or a D-frame net in lotic waters. Aquatic weeds were also hand-collected for periphytic species. (2) A part of chironomids captured underwater was reared to adults in the laboratory. They were kept in water aerated with a pump in tanks. (3) Midges were collected with an emergence trap or a sweeping net on and around waters where they emerged.

Área de Estudo Chironomid species were captured in Japan and Tuvalu from 1989 to 2015.
Controle de Qualidade Scientific names were validated against the Catalogue of the Insects of Japan Vol.8 (Yamamoto and Yamamoto 2014) and the GBIF Backbone Taxonomy.

Descrição dos passos do método:

  1. Morphological identification was used to determine the species names of specimens, along with DNA barcoding and ecological observations for a limited number of species. Geographic coordinates and uncertainties were measured using gazetteers such as Google Maps following procedures described in Chapman and Wieczorek (2006). Chironomid specimen records were extracted from the Chironomid DNA Barcode Database and organized into species occurrence data using a MySQL database.

Citações bibliográficas

  1. Chapman, A.D. and Wieczorek, J. (Eds) (2006) Guide to Best Practices for Georeferencing. Global Biodiversity Information Facility, Copenhagen, 90 pp.
  2. Yamamoto, M. and Yamamoto, N. (2014) Family Chironomidae. In: Editorial Committee of Catalogue of the Insects of Japan (ed.): Catalogue of the Insects of Japan Vol.8 Diptera. Part 1: Nematocera-Brachycera Aschiza, Touka Shobo, Fukuoka, Japan, pp. 237-362.

Metadados Adicionais

Identificadores alternativos 02cc981e-d1d8-4ea6-9db5-dfb73acca024
https://gbif.jp/ipt/resource?r=nies_cdbd