Sampling event

Tree survey in the tropical forest of Pasoh Forest Reserve, Malaysia from 2016 to 2018

Последняя версия опубликована National Institute of Genetics, ROIS 26 января 2024 г. National Institute of Genetics, ROIS
Дата публикации:
26 января 2024 г.
Опубликовано:
National Institute of Genetics, ROIS
Лицензия:
CC-BY 4.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 3 Записи в English (2 MB) - Частота обновления: not planned
Метаданные в формате EML Скачать в English (43 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (15 KB)

Описание

This study aimed to explore the vertical patterns of aboveground biomass and tree species diversity in the tropical forest of Pasoh Forest Reserve, Malaysia. To achieve this goal, we used a combination of field surveys and drone technology to gather data on species diversity, tree height (H), and tree diameter at breast height (D). As all trees in the 6 ha plot were tagged and identified, we used the data to classify the taxonomy and calculate species diversity indices. In this dataset, 8,148 individuals of tree species belonging to 72 families are included. Observed D in 2016 and 2018 and estimated D in 2017 are also provided. This study is published as an open access paper in the Environmental Research: Ecology at https://doi.org/10.1088/2752-664X/acf9a9. Data derived from the study including estimated tree heights is provided at https://doi.org/10.5281/zenodo.7866644.

Записи данных

Данные этого sampling event ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 3 записей.

Также в наличии 2 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

Event (core)
3
ExtendedMeasurementOrFact 
24149
Occurrence 
24149

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

National Institute for Environmental Studies (2024) Tree survey in the tropical forest of Pasoh Forest Reserve, Malaysia from 2016 to 2018. Version 1. National Institute for Environmental Studies. Dataset/Sampling-event.

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является National Institute of Genetics, ROIS. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 73a01536-a050-4edb-a704-1bb12f1b7da8.  National Institute of Genetics, ROIS отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке GBIF Japan.

Ключевые слова

Samplingevent; Digital Canopy Height Model; functional diversity; height–diameter model; structure-from-motion photogrammetry; Pasoh Forest Reserve

Контакты

Yayoi Takeuchi
  • Metadata Provider
  • Author
  • Originator
  • Point Of Contact
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Habura Borigin
  • Author
  • Originator
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Kaoru Niiyama
  • Author
  • Originator
Forestry and Forest Products Research Institute
Tamotsu Sato
  • Author
  • Originator
Forestry and Forest Products Research Institute
Keiichi Fukaya
  • Author
  • Originator
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Toshinori Okuda
  • Author
  • Originator
Hiroshima University
Masato Hayashi
  • Author
  • Originator
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Hamdan Omar
  • Author
  • Originator
Forest Research Institute Malaysia (FRIM)
Azharizan Mohammad Norizan
  • Author
  • Originator
Forest Research Institute Malaysia (FRIM)
Biodiversity Division
  • Point Of Contact
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Kumiko Totsu
  • Programmer
Specialist (Database engineer)
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP

Географический охват

Pasoh Forest Reserve, Malaysia

Ограничивающие координаты Юг Запад [2,971, 102,298], Север Восток [2,974, 102,3]

Таксономический охват

Trees species from 72 families.

Family Achariaceae, Anacardiaceae, Anisophylleaceae, Annonaceae, Apocynaceae, Aquifoliaceae, Asparagaceae, Bignoniaceae, Boraginaceae, Burseraceae, Calophyllaceae, Cannabaceae, Cardiopteridaceae, Celastraceae, Centroplacaceae, Chrysobalanaceae, Clusiaceae, Combretaceae, Connaraceae, Cornaceae, Ctenolophonaceae, Dilleniaceae, Dipterocarpaceae, Ebenaceae, Elaeocarpaceae, Erythroxylaceae, Euphorbiaceae, Fabaceae, Fagaceae, Irvingiaceae, Ixonanthaceae, Lamiaceae, Lauraceae, Lecythidaceae, Magnoliaceae, Malvaceae, Melastomataceae, Meliaceae, Moraceae, Myristicaceae, Myrtaceae, Ochnaceae, Olacaceae, Oleaceae, Oxalidaceae, Pandaceae, Passifloraceae, Penaeaceae, Pentaphylacaceae, Peraceae, Phyllanthaceae, Picrodendraceae, Polygalaceae, Primulaceae, Proteaceae, Putranjivaceae, Rhizophoraceae, Rosaceae, Rubiaceae, Rutaceae, Salicaceae, Santalaceae, Sapindaceae, Sapotaceae, Simaroubaceae, Stemonuraceae, Styracaceae, Symplocaceae, Theaceae, Thymelaeaceae, Trigoniaceae, Violaceae

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 2016-01-27 / 2018-02-07

Методы сбора

The survey of tree growth and survival was conducted in the 6 ha plot from 27 January–5 February in 2016 and 31 January–7 February in 2018. For buttressed trees, note that D was corrected using a taper model, and then D was estimated in September 2017 using a growth model to adjust the size of D and H in Sept 2017 for subsequent modeling analysis. Further information on methods can be found in the paper (Takeuchi et al. 2023).

Охват исследования Our field survey was conducted in Pasoh Forest Reserve, Negeri Sembilan, Malaysia (2°59'N, 102°18'E, altitude 75–150 m). We used a 6 ha plot within Pasoh Forest Reserve, which was established in 1994, and all living trees with a stem diameter at breast height (D)>=5 cm were tagged and identified at the species level, with a census every 2 years (Niiyama et al 2003).
Контроль качества Scientific names were checked against the GBIF Backbone Taxonomy (GBIF Secretariat 2023).

Описание этапа методики:

  1. Tree census data was formatted into event data. Range of dates were provided in eventDate for 2016 and 2018.
  2. Occurrences of each individuals between 2016 and 2018 associated with events were listed.
  3. Observed tree diameter at breast height (D) in 2016 and 2018 and estimated D in 2017 were listed in the measurement extension file.

Библиографические ссылки

  1. GBIF Secretariat (2023). GBIF Backbone Taxonomy. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/39omei accessed via GBIF.org on 2024-01-15. 10.15468/39omei
  2. Niiyama K et al (2003) Regeneration of a clear-cut plot in a lowland dipterocarp forest in Pasoh Forest Reserve, Peninsular Malaysia Pasoh: Ecology of a Lowland Rain Forest in Peninsular Malaysia ed T Okuda (Springer) 259–68
  3. Takeuchi, Y., Borjigin, H., Niiyama, K., Sato, T., Fukaya, K., Okuda, T., Hayashi M., Omar H., Norizan, A. M. (2023) UAV-based height measurement and height-diameter model integrating taxonomic effects: exploring vertical structure of aboveground biomass and species diversity in a Malaysian tropical forest. Environmental Research: Ecology 2 035003. https://doi.org/10.1088/2752-664X/acf9a9 10.1088/2752-664X/acf9a9

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы https://gbif.jp/ipt/resource?r=nies_pasoh_trees