Description
This study aimed to explore the vertical patterns of aboveground biomass and tree species diversity in the tropical forest of Pasoh Forest Reserve, Malaysia. To achieve this goal, we used a combination of field surveys and drone technology to gather data on species diversity, tree height (H), and tree diameter at breast height (D). As all trees in the 6 ha plot were tagged and identified, we used the data to classify the taxonomy and calculate species diversity indices. In this dataset, 8,148 individuals of tree species belonging to 72 families are included. Observed D in 2016 and 2018 and estimated D in 2017 are also provided. This study is published as an open access paper in the Environmental Research: Ecology at https://doi.org/10.1088/2752-664X/acf9a9. Data derived from the study including estimated tree heights is provided at https://doi.org/10.5281/zenodo.7866644.
Enregistrements de données
Les données de cette ressource données d'échantillonnage ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 3 enregistrements.
2 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.
Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.
Versions
Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.
Comment citer
Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:
National Institute for Environmental Studies (2024) Tree survey in the tropical forest of Pasoh Forest Reserve, Malaysia from 2016 to 2018. Version 1. National Institute for Environmental Studies. Dataset/Sampling-event.
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est National Institute of Genetics, ROIS. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.
Enregistrement GBIF
Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 73a01536-a050-4edb-a704-1bb12f1b7da8. National Institute of Genetics, ROIS publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du GBIF Japan.
Mots-clé
Samplingevent; Digital Canopy Height Model; functional diversity; height–diameter model; structure-from-motion photogrammetry; Pasoh Forest Reserve
Contacts
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Couverture géographique
Pasoh Forest Reserve, Malaysia
| Enveloppe géographique | Sud Ouest [2,971, 102,298], Nord Est [2,974, 102,3] |
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Couverture taxonomique
Trees species from 72 families.
| Family | Achariaceae, Anacardiaceae, Anisophylleaceae, Annonaceae, Apocynaceae, Aquifoliaceae, Asparagaceae, Bignoniaceae, Boraginaceae, Burseraceae, Calophyllaceae, Cannabaceae, Cardiopteridaceae, Celastraceae, Centroplacaceae, Chrysobalanaceae, Clusiaceae, Combretaceae, Connaraceae, Cornaceae, Ctenolophonaceae, Dilleniaceae, Dipterocarpaceae, Ebenaceae, Elaeocarpaceae, Erythroxylaceae, Euphorbiaceae, Fabaceae, Fagaceae, Irvingiaceae, Ixonanthaceae, Lamiaceae, Lauraceae, Lecythidaceae, Magnoliaceae, Malvaceae, Melastomataceae, Meliaceae, Moraceae, Myristicaceae, Myrtaceae, Ochnaceae, Olacaceae, Oleaceae, Oxalidaceae, Pandaceae, Passifloraceae, Penaeaceae, Pentaphylacaceae, Peraceae, Phyllanthaceae, Picrodendraceae, Polygalaceae, Primulaceae, Proteaceae, Putranjivaceae, Rhizophoraceae, Rosaceae, Rubiaceae, Rutaceae, Salicaceae, Santalaceae, Sapindaceae, Sapotaceae, Simaroubaceae, Stemonuraceae, Styracaceae, Symplocaceae, Theaceae, Thymelaeaceae, Trigoniaceae, Violaceae |
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Couverture temporelle
| Date de début / Date de fin | 2016-01-27 / 2018-02-07 |
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Méthodes d'échantillonnage
The survey of tree growth and survival was conducted in the 6 ha plot from 27 January–5 February in 2016 and 31 January–7 February in 2018. For buttressed trees, note that D was corrected using a taper model, and then D was estimated in September 2017 using a growth model to adjust the size of D and H in Sept 2017 for subsequent modeling analysis. Further information on methods can be found in the paper (Takeuchi et al. 2023).
| Etendue de l'étude | Our field survey was conducted in Pasoh Forest Reserve, Negeri Sembilan, Malaysia (2°59'N, 102°18'E, altitude 75–150 m). We used a 6 ha plot within Pasoh Forest Reserve, which was established in 1994, and all living trees with a stem diameter at breast height (D)>=5 cm were tagged and identified at the species level, with a census every 2 years (Niiyama et al 2003). |
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| Contrôle qualité | Scientific names were checked against the GBIF Backbone Taxonomy (GBIF Secretariat 2023). |
Description des étapes de la méthode:
- Tree census data was formatted into event data. Range of dates were provided in eventDate for 2016 and 2018.
- Occurrences of each individuals between 2016 and 2018 associated with events were listed.
- Observed tree diameter at breast height (D) in 2016 and 2018 and estimated D in 2017 were listed in the measurement extension file.
Citations bibliographiques
- GBIF Secretariat (2023). GBIF Backbone Taxonomy. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/39omei accessed via GBIF.org on 2024-01-15. 10.15468/39omei
- Niiyama K et al (2003) Regeneration of a clear-cut plot in a lowland dipterocarp forest in Pasoh Forest Reserve, Peninsular Malaysia Pasoh: Ecology of a Lowland Rain Forest in Peninsular Malaysia ed T Okuda (Springer) 259–68
- Takeuchi, Y., Borjigin, H., Niiyama, K., Sato, T., Fukaya, K., Okuda, T., Hayashi M., Omar H., Norizan, A. M. (2023) UAV-based height measurement and height-diameter model integrating taxonomic effects: exploring vertical structure of aboveground biomass and species diversity in a Malaysian tropical forest. Environmental Research: Ecology 2 035003. https://doi.org/10.1088/2752-664X/acf9a9 10.1088/2752-664X/acf9a9
Métadonnées additionnelles
| Identifiants alternatifs | https://gbif.jp/ipt/resource?r=nies_pasoh_trees |
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