Sampling event

Tree survey in the tropical forest of Pasoh Forest Reserve, Malaysia from 2016 to 2018

最新バージョン National Institute of Genetics, ROIS によって公開 2024/01/26 National Institute of Genetics, ROIS
公開日:
2024/01/26
ライセンス:
CC-BY 4.0

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説明

This study aimed to explore the vertical patterns of aboveground biomass and tree species diversity in the tropical forest of Pasoh Forest Reserve, Malaysia. To achieve this goal, we used a combination of field surveys and drone technology to gather data on species diversity, tree height (H), and tree diameter at breast height (D). As all trees in the 6 ha plot were tagged and identified, we used the data to classify the taxonomy and calculate species diversity indices. In this dataset, 8,148 individuals of tree species belonging to 72 families are included. Observed D in 2016 and 2018 and estimated D in 2017 are also provided. This study is published as an open access paper in the Environmental Research: Ecology at https://doi.org/10.1088/2752-664X/acf9a9. Data derived from the study including estimated tree heights is provided at https://doi.org/10.5281/zenodo.7866644.

データ レコード

この sampling event リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、3 レコードが含まれています。

拡張データ テーブルは2 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

Event (コア)
3
ExtendedMeasurementOrFact 
24149
Occurrence 
24149

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

National Institute for Environmental Studies (2024) Tree survey in the tropical forest of Pasoh Forest Reserve, Malaysia from 2016 to 2018. Version 1. National Institute for Environmental Studies. Dataset/Sampling-event.

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は National Institute of Genetics, ROIS。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 73a01536-a050-4edb-a704-1bb12f1b7da8が割り当てられています。   GBIF Japan によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているNational Institute of Genetics, ROIS が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Samplingevent; Digital Canopy Height Model; functional diversity; height–diameter model; structure-from-motion photogrammetry; Pasoh Forest Reserve

連絡先

Yayoi Takeuchi
  • メタデータ提供者
  • 論文著者
  • 最初のデータ採集者
  • 連絡先
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Habura Borigin
  • 論文著者
  • 最初のデータ採集者
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Kaoru Niiyama
  • 論文著者
  • 最初のデータ採集者
Forestry and Forest Products Research Institute
Tamotsu Sato
  • 論文著者
  • 最初のデータ採集者
Forestry and Forest Products Research Institute
Keiichi Fukaya
  • 論文著者
  • 最初のデータ採集者
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Toshinori Okuda
  • 論文著者
  • 最初のデータ採集者
Hiroshima University
Masato Hayashi
  • 論文著者
  • 最初のデータ採集者
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Hamdan Omar
  • 論文著者
  • 最初のデータ採集者
Forest Research Institute Malaysia (FRIM)
Azharizan Mohammad Norizan
  • 論文著者
  • 最初のデータ採集者
Forest Research Institute Malaysia (FRIM)
Biodiversity Division
  • 連絡先
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Kumiko Totsu
  • プログラマー
Specialist (Database engineer)
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP

地理的範囲

Pasoh Forest Reserve, Malaysia

座標(緯度経度) 南 西 [2.971, 102.298], 北 東 [2.974, 102.3]

生物分類学的範囲

Trees species from 72 families.

Family Achariaceae, Anacardiaceae, Anisophylleaceae, Annonaceae, Apocynaceae, Aquifoliaceae, Asparagaceae, Bignoniaceae, Boraginaceae, Burseraceae, Calophyllaceae, Cannabaceae, Cardiopteridaceae, Celastraceae, Centroplacaceae, Chrysobalanaceae, Clusiaceae, Combretaceae, Connaraceae, Cornaceae, Ctenolophonaceae, Dilleniaceae, Dipterocarpaceae, Ebenaceae, Elaeocarpaceae, Erythroxylaceae, Euphorbiaceae, Fabaceae, Fagaceae, Irvingiaceae, Ixonanthaceae, Lamiaceae, Lauraceae, Lecythidaceae, Magnoliaceae, Malvaceae, Melastomataceae, Meliaceae, Moraceae, Myristicaceae, Myrtaceae, Ochnaceae, Olacaceae, Oleaceae, Oxalidaceae, Pandaceae, Passifloraceae, Penaeaceae, Pentaphylacaceae, Peraceae, Phyllanthaceae, Picrodendraceae, Polygalaceae, Primulaceae, Proteaceae, Putranjivaceae, Rhizophoraceae, Rosaceae, Rubiaceae, Rutaceae, Salicaceae, Santalaceae, Sapindaceae, Sapotaceae, Simaroubaceae, Stemonuraceae, Styracaceae, Symplocaceae, Theaceae, Thymelaeaceae, Trigoniaceae, Violaceae

時間的範囲

開始日 / 終了日 2016-01-27 / 2018-02-07

収集方法

The survey of tree growth and survival was conducted in the 6 ha plot from 27 January–5 February in 2016 and 31 January–7 February in 2018. For buttressed trees, note that D was corrected using a taper model, and then D was estimated in September 2017 using a growth model to adjust the size of D and H in Sept 2017 for subsequent modeling analysis. Further information on methods can be found in the paper (Takeuchi et al. 2023).

Study Extent Our field survey was conducted in Pasoh Forest Reserve, Negeri Sembilan, Malaysia (2°59'N, 102°18'E, altitude 75–150 m). We used a 6 ha plot within Pasoh Forest Reserve, which was established in 1994, and all living trees with a stem diameter at breast height (D)>=5 cm were tagged and identified at the species level, with a census every 2 years (Niiyama et al 2003).
Quality Control Scientific names were checked against the GBIF Backbone Taxonomy (GBIF Secretariat 2023).

Method step description:

  1. Tree census data was formatted into event data. Range of dates were provided in eventDate for 2016 and 2018.
  2. Occurrences of each individuals between 2016 and 2018 associated with events were listed.
  3. Observed tree diameter at breast height (D) in 2016 and 2018 and estimated D in 2017 were listed in the measurement extension file.

書誌情報の引用

  1. GBIF Secretariat (2023). GBIF Backbone Taxonomy. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/39omei accessed via GBIF.org on 2024-01-15. 10.15468/39omei
  2. Niiyama K et al (2003) Regeneration of a clear-cut plot in a lowland dipterocarp forest in Pasoh Forest Reserve, Peninsular Malaysia Pasoh: Ecology of a Lowland Rain Forest in Peninsular Malaysia ed T Okuda (Springer) 259–68
  3. Takeuchi, Y., Borjigin, H., Niiyama, K., Sato, T., Fukaya, K., Okuda, T., Hayashi M., Omar H., Norizan, A. M. (2023) UAV-based height measurement and height-diameter model integrating taxonomic effects: exploring vertical structure of aboveground biomass and species diversity in a Malaysian tropical forest. Environmental Research: Ecology 2 035003. https://doi.org/10.1088/2752-664X/acf9a9 10.1088/2752-664X/acf9a9

追加のメタデータ