Sampling event

A dataset for vascular plant diversity monitoring for the natural World Heritage site on Amami-Oshima Island, Tokunoshima Island, and the northern Okinawa Island

Последняя версия опубликована National Institute of Genetics, ROIS 27 июля 2022 г. National Institute of Genetics, ROIS
Дата публикации:
27 июля 2022 г.
Лицензия:
CC-BY 4.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 121 Записи в English (179 KB) - Частота обновления: as needed
Метаданные в формате EML Скачать в English (38 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (16 KB)

Описание

This dataset presents the vascular plant biodiversity sampled from four plots on Amami-Oshima Island, three plots on Tokunoshima Island, and one plot on Okinawa Island within the natural World Heritage site, and an additional three plots in southern Kyushu using the standardized belt-transect survey method during July 2012 to October 2020. The dataset includes 99 families, 215 genera, and 380 species of vascular plants, and provides species occurrence among 10 subplots for all vascular plants, girth at breast height (GBH) and height of all trees and climbers with GBH ≥ 3.2 cm or height ≥ 4 m in each 5 × 100 m plot. This dataset serves as baseline data for subsequent plant diversity monitoring of the natural World Heritage site. This dataset is published as a data paper in Ecological Research (see https://doi.org/10.1111/1440-1703.12340).

Записи данных

Данные этого sampling event ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 121 записей.

Также в наличии 2 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

Event (core)
121
ExtendedMeasurementOrFact 
6426
Occurrence 
5301

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

National Institute for Environmental Studies (2022) The baseline dataset for plant diversity monitoring of World Natural Heritage site on Amami-Oshima Island, Tokunoshima Island and Northern part of Okinawa Island. Version 1. National Institute for Environmental Studies. Dataset/Sampling-event.

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является National Institute of Genetics, ROIS. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: a51f47ec-f320-4bd4-a8d6-fc75732bfce2.  National Institute of Genetics, ROIS отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке GBIF Japan.

Ключевые слова

Samplingevent; Amami islands; biodiversity; community structure; Kagoshima; Ryukyu islands; Samplingevent

Контакты

Toyama Hironori
  • Author
Research Associate
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Shuichiro Tagane
  • Author
Assistant Professor
The Kagoshima University Museum, Kagoshima University
1-21-30 Korimoto
890-0065 Kagoshima
Kagoshima
JP
Kumiko Totsu
  • Author
Specialist (Database engineer)
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Kengo Fuse
  • Author
Director
Kyushu Open University
744 Motooka
819-0395 Fukuoka
Fukuoka
JP
Nariko Toyama
  • Author
Assistant Staff
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Biodiversity Division
  • Point Of Contact
National Institute for Environmental Studies
JP
Shin Ugawa
  • Author
Associate Professor
Kagoshima University
1-21-24 Korimoto
890-8580 Kagoshima
Kagoshima
JP
Shin-ichiro Aiba
  • Author
Professor
Hokkaido University
N10 W5 Kita-ku
060-0810 Sapporo
Sapporo
JP
Eizi Suzuki
  • Author
Specially Appointed Professor
Kagoshima University
1-21-24 Korimoto
890-8580 Kagoshima
Kagoshima
JP
Taku Kadoya
  • Author
Head
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Atsushi Takashima
  • Author
Assistant Professor
University of the Ryukyus
685 Yona
905-1427 Kunigami
Okinawa
JP
Yayoi Takeuchi
  • Metadata Provider
  • Author
  • Originator
  • Point Of Contact
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Kaito Yamazaki
  • Author
Kagoshima University
1-21-24 Korimoto
890-8580 Kagoshima
Kagoshima
JP

Географический охват

Kagoshima and Okinawa prefecture, Japan

Ограничивающие координаты Юг Запад [26, 128], Север Восток [33, 132]

Таксономический охват

99 families, 215 genera and 381 species of vascular plants

Family Acanthaceae, Actinidiaceae, Adoxaceae, Anacardiaceae, Apocynaceae, Aquifoliaceae, Araceae, Araliaceae, Aristolochiaceae, Asparagaceae, Aspleniaceae, Asteraceae, Athyriaceae, Blechnaceae, Cannabaceae, Caprifoliaceae, Celastraceae, Chloranthaceae, Cibotiaceae, Colchicaceae, Commelinaceae, Convolvulaceae, Cucurbitaceae, Cyatheaceae, Cyperaceae, Daphniphyllaceae, Davalliaceae, Dennstaedtiaceae, Dipteridaceae, Dryopteridaceae, Ebenaceae, Elaeagnaceae, Elaeocarpaceae, Ericaceae, Euphorbiaceae, Fabaceae, Fagaceae, Garryaceae, Gentianaceae, Gesneriaceae, Gleicheniaceae, Hamamelidaceae, Helwingiaceae, Hydrangeaceae, Hymenophyllaceae, Iteaceae, Lamiaceae, Lardizabalaceae, Lauraceae, Lindsaeaceae, Loganiaceae, Lycopodiaceae, Marattiaceae, Melanthiaceae, Melastomataceae, Menispermaceae, Mitrastemonaceae, Moraceae, Myricaceae, Myrtaceae, Nephrolepidaceae, Oleaceae, Ophioglossaceae, Orchidaceae, Pentaphylacaceae, Phyllanthaceae, Piperaceae, Plagiogyriaceae, Poaceae, Podocarpaceae, Polygonaceae, Polypodiaceae, Primulaceae, Proteaceae, Psilotaceae, Pteridaceae, Ranunculaceae, Rosaceae, Rubiaceae, Rutaceae, Sabiaceae, Salicaceae, Schisandraceae, Schoepfiaceae, Selaginellaceae, Smilacaceae, Solanaceae, Staphyleaceae, Stemonaceae, Styracaceae, Symplocaceae, Taxaceae, Tectariaceae, Theaceae, Thelypteridaceae, Urticaceae, Violaceae, Vitaceae, Zingiberaceae

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 2012-07-01 / 2020-10-24

Данные проекта

Описание отсутсвует

Название 1. Climate Change Adaptation Research Program; 2. Scientific Research on Priority Areas (on Island Research)
Финансирование 1. National Institute for Environmental Studies, Japan; 2. Kagoshima University

Исполнители проекта:

Eizi Suzuki *2
Hironori Toyama *1
Nariko Toyama *1
Shuichiro Tagane *2
Kaito Yamazaki *2
Taku Kadoya *1
Yayoi Takeuchi *1
Kumiko Totsu *1

Методы сбора

We placed a rectangular plot (5 × 100 m) and divided it into 10 subplots (5 × 10 m) in which all vascular plant species were listed and all stems of a certain height and GBH were recorded. The plot was marked with GPS coordinates noting the beginning and ending points using GPSMAP 64SC (Garmin Ltd.). Stems with girth at breast height (GBH) ≥3.2 cm in Plots A–G and I and stem heights taller than 4 m in Plots H, J, and K were recorded. Tree height was assessed by visual estimation, and GBH was measured using a measuring tape. To calibrate the visual estimates of tree height, we sometimes used a 15 m carbon pole (CAH04-015S, Taketani Trading Co., Ltd.) to round to the nearest 0.5 m. As two individuals of Quercus glauca Thun. var. amamiana (Hatus.) Hatus. ex H.Ohba in Plot F had many basal shoots (53 and 24, respectively), we measured all shoots with GBH ≥ 10 cm and randomly selected five shoots with GBH ≥ 3.2 cm but smaller than 10 cm, thus, the data contains the occurrence of all shoots with GBH ≥ 3.2 cm, and GBH and height of all shoots with GBH ≥ 10 cm and of five shoots with GBH ≥ 3.2 cm but smaller than 10 cm.

Охват исследования The data were obtained from evergreen broadleaf forests at four, three, one and three locations on Amami-Ohisma island, Tokunoshima island, Okinawa island, and southern Kyushu with a nearby island (Shimokoshiki), respectively.
Контроль качества Species identification was performed in the field and recorded in Japanese common names. The plant nomenclature followed the YList (Yonekura & Kajita 2003–) and spelling of scientific names were checked against the GBIF Backbone Taxonomy (GBIF Secretariat 2021). When we found an inconsistency of taxonomic treatment between two databases, we followed YList (Yonekura & Kajita, 2003–). Most plants were identified to species-level including subspecies and varieties, but seven taxa, Carex sp. 1 and 2, Calanthe sp. 1, Trichosanthes sp. 1, Goodyera sp. 1, Malaxis sp. 1 Lycianthes cf. biflora (Lour.) Bitter and Asarum cf. simile Hatus., were unidentified due to its lacking reproductive organs which are important for their classification. The species identification level and the doubts of the identification were mentioned in “taxonRank” and “identificationQualifier,” respectively

Описание этапа методики:

  1. Geographic coordinates are generalized to six representative points (A-D, E-G, H, I, J, K) with an uncertainty radius of 10 km, since exact coordinates of the study plots are not provided for conservation reasons.

Библиографические ссылки

  1. Yonekura K, Kajita T (2003–) BG Plants: index for Japanese scientific plant names: Ylist. .
  2. GBIF Secretariat (2021) GBIF Backbone Taxonomy. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/39omei accessed via GBIF.org on 2021-06-03. 10.15468/39omei

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы a51f47ec-f320-4bd4-a8d6-fc75732bfce2
https://www.gbif.jp/ipt/resource?r=nies_otskplants