Données d'échantillonnage

A dataset for vascular plant diversity monitoring for the natural World Heritage site on Amami-Oshima Island, Tokunoshima Island, and the northern Okinawa Island

Dernière version Publié par National Institute of Genetics, ROIS le 27 juillet 2022 National Institute of Genetics, ROIS
Date de publication:
27 juillet 2022
Licence:
CC-BY 4.0

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Description

This dataset presents the vascular plant biodiversity sampled from four plots on Amami-Oshima Island, three plots on Tokunoshima Island, and one plot on Okinawa Island within the natural World Heritage site, and an additional three plots in southern Kyushu using the standardized belt-transect survey method during July 2012 to October 2020. The dataset includes 99 families, 215 genera, and 380 species of vascular plants, and provides species occurrence among 10 subplots for all vascular plants, girth at breast height (GBH) and height of all trees and climbers with GBH ≥ 3.2 cm or height ≥ 4 m in each 5 × 100 m plot. This dataset serves as baseline data for subsequent plant diversity monitoring of the natural World Heritage site. This dataset is published as a data paper in Ecological Research (see https://doi.org/10.1111/1440-1703.12340).

Enregistrements de données

Les données de cette ressource données d'échantillonnage ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 121 enregistrements.

2 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

Event (noyau)
121
ExtendedMeasurementOrFact 
6426
Occurrence 
5301

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

National Institute for Environmental Studies (2022) The baseline dataset for plant diversity monitoring of World Natural Heritage site on Amami-Oshima Island, Tokunoshima Island and Northern part of Okinawa Island. Version 1. National Institute for Environmental Studies. Dataset/Sampling-event.

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est National Institute of Genetics, ROIS. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : a51f47ec-f320-4bd4-a8d6-fc75732bfce2.  National Institute of Genetics, ROIS publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du GBIF Japan.

Mots-clé

Samplingevent; Amami islands; biodiversity; community structure; Kagoshima; Ryukyu islands; Samplingevent

Contacts

Toyama Hironori
  • Auteur
Research Associate
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Shuichiro Tagane
  • Auteur
Assistant Professor
The Kagoshima University Museum, Kagoshima University
1-21-30 Korimoto
890-0065 Kagoshima
Kagoshima
JP
Kumiko Totsu
  • Auteur
Specialist (Database engineer)
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Kengo Fuse
  • Auteur
Director
Kyushu Open University
744 Motooka
819-0395 Fukuoka
Fukuoka
JP
Nariko Toyama
  • Auteur
Assistant Staff
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Biodiversity Division
  • Personne De Contact
National Institute for Environmental Studies
JP
Shin Ugawa
  • Auteur
Associate Professor
Kagoshima University
1-21-24 Korimoto
890-8580 Kagoshima
Kagoshima
JP
Shin-ichiro Aiba
  • Auteur
Professor
Hokkaido University
N10 W5 Kita-ku
060-0810 Sapporo
Sapporo
JP
Eizi Suzuki
  • Auteur
Specially Appointed Professor
Kagoshima University
1-21-24 Korimoto
890-8580 Kagoshima
Kagoshima
JP
Taku Kadoya
  • Auteur
Head
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Atsushi Takashima
  • Auteur
Assistant Professor
University of the Ryukyus
685 Yona
905-1427 Kunigami
Okinawa
JP
Yayoi Takeuchi
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Auteur
  • Créateur
  • Personne De Contact
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Kaito Yamazaki
  • Auteur
Kagoshima University
1-21-24 Korimoto
890-8580 Kagoshima
Kagoshima
JP

Couverture géographique

Kagoshima and Okinawa prefecture, Japan

Enveloppe géographique Sud Ouest [26, 128], Nord Est [33, 132]

Couverture taxonomique

99 families, 215 genera and 381 species of vascular plants

Family Acanthaceae, Actinidiaceae, Adoxaceae, Anacardiaceae, Apocynaceae, Aquifoliaceae, Araceae, Araliaceae, Aristolochiaceae, Asparagaceae, Aspleniaceae, Asteraceae, Athyriaceae, Blechnaceae, Cannabaceae, Caprifoliaceae, Celastraceae, Chloranthaceae, Cibotiaceae, Colchicaceae, Commelinaceae, Convolvulaceae, Cucurbitaceae, Cyatheaceae, Cyperaceae, Daphniphyllaceae, Davalliaceae, Dennstaedtiaceae, Dipteridaceae, Dryopteridaceae, Ebenaceae, Elaeagnaceae, Elaeocarpaceae, Ericaceae, Euphorbiaceae, Fabaceae, Fagaceae, Garryaceae, Gentianaceae, Gesneriaceae, Gleicheniaceae, Hamamelidaceae, Helwingiaceae, Hydrangeaceae, Hymenophyllaceae, Iteaceae, Lamiaceae, Lardizabalaceae, Lauraceae, Lindsaeaceae, Loganiaceae, Lycopodiaceae, Marattiaceae, Melanthiaceae, Melastomataceae, Menispermaceae, Mitrastemonaceae, Moraceae, Myricaceae, Myrtaceae, Nephrolepidaceae, Oleaceae, Ophioglossaceae, Orchidaceae, Pentaphylacaceae, Phyllanthaceae, Piperaceae, Plagiogyriaceae, Poaceae, Podocarpaceae, Polygonaceae, Polypodiaceae, Primulaceae, Proteaceae, Psilotaceae, Pteridaceae, Ranunculaceae, Rosaceae, Rubiaceae, Rutaceae, Sabiaceae, Salicaceae, Schisandraceae, Schoepfiaceae, Selaginellaceae, Smilacaceae, Solanaceae, Staphyleaceae, Stemonaceae, Styracaceae, Symplocaceae, Taxaceae, Tectariaceae, Theaceae, Thelypteridaceae, Urticaceae, Violaceae, Vitaceae, Zingiberaceae

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2012-07-01 / 2020-10-24

Données sur le projet

Pas de description disponible

Titre 1. Climate Change Adaptation Research Program; 2. Scientific Research on Priority Areas (on Island Research)
Financement 1. National Institute for Environmental Studies, Japan; 2. Kagoshima University

Les personnes impliquées dans le projet:

Eizi Suzuki *2
Hironori Toyama *1
Nariko Toyama *1
Shuichiro Tagane *2
Kaito Yamazaki *2
Taku Kadoya *1
Yayoi Takeuchi *1
Kumiko Totsu *1

Méthodes d'échantillonnage

We placed a rectangular plot (5 × 100 m) and divided it into 10 subplots (5 × 10 m) in which all vascular plant species were listed and all stems of a certain height and GBH were recorded. The plot was marked with GPS coordinates noting the beginning and ending points using GPSMAP 64SC (Garmin Ltd.). Stems with girth at breast height (GBH) ≥3.2 cm in Plots A–G and I and stem heights taller than 4 m in Plots H, J, and K were recorded. Tree height was assessed by visual estimation, and GBH was measured using a measuring tape. To calibrate the visual estimates of tree height, we sometimes used a 15 m carbon pole (CAH04-015S, Taketani Trading Co., Ltd.) to round to the nearest 0.5 m. As two individuals of Quercus glauca Thun. var. amamiana (Hatus.) Hatus. ex H.Ohba in Plot F had many basal shoots (53 and 24, respectively), we measured all shoots with GBH ≥ 10 cm and randomly selected five shoots with GBH ≥ 3.2 cm but smaller than 10 cm, thus, the data contains the occurrence of all shoots with GBH ≥ 3.2 cm, and GBH and height of all shoots with GBH ≥ 10 cm and of five shoots with GBH ≥ 3.2 cm but smaller than 10 cm.

Etendue de l'étude The data were obtained from evergreen broadleaf forests at four, three, one and three locations on Amami-Ohisma island, Tokunoshima island, Okinawa island, and southern Kyushu with a nearby island (Shimokoshiki), respectively.
Contrôle qualité Species identification was performed in the field and recorded in Japanese common names. The plant nomenclature followed the YList (Yonekura & Kajita 2003–) and spelling of scientific names were checked against the GBIF Backbone Taxonomy (GBIF Secretariat 2021). When we found an inconsistency of taxonomic treatment between two databases, we followed YList (Yonekura & Kajita, 2003–). Most plants were identified to species-level including subspecies and varieties, but seven taxa, Carex sp. 1 and 2, Calanthe sp. 1, Trichosanthes sp. 1, Goodyera sp. 1, Malaxis sp. 1 Lycianthes cf. biflora (Lour.) Bitter and Asarum cf. simile Hatus., were unidentified due to its lacking reproductive organs which are important for their classification. The species identification level and the doubts of the identification were mentioned in “taxonRank” and “identificationQualifier,” respectively

Description des étapes de la méthode:

  1. Geographic coordinates are generalized to six representative points (A-D, E-G, H, I, J, K) with an uncertainty radius of 10 km, since exact coordinates of the study plots are not provided for conservation reasons.

Citations bibliographiques

  1. Yonekura K, Kajita T (2003–) BG Plants: index for Japanese scientific plant names: Ylist. .
  2. GBIF Secretariat (2021) GBIF Backbone Taxonomy. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/39omei accessed via GBIF.org on 2021-06-03. 10.15468/39omei

Métadonnées additionnelles

Identifiants alternatifs a51f47ec-f320-4bd4-a8d6-fc75732bfce2
https://www.gbif.jp/ipt/resource?r=nies_otskplants