Sampling event

A dataset for vascular plant diversity monitoring for the natural World Heritage site on Amami-Oshima Island, Tokunoshima Island, and the northern Okinawa Island

最新バージョン National Institute of Genetics, ROIS によって公開 2022/07/27 National Institute of Genetics, ROIS
公開日:
2022/07/27
ライセンス:
CC-BY 4.0

DwC-A形式のリソース データまたは EML / RTF 形式のリソース メタデータの最新バージョンをダウンロード:

DwC ファイルとしてのデータ ダウンロード 121 レコード English で (179 KB) - 更新頻度: as needed
EML ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (38 KB)
RTF ファイルとしてのメタデータ ダウンロード English で (16 KB)

説明

This dataset presents the vascular plant biodiversity sampled from four plots on Amami-Oshima Island, three plots on Tokunoshima Island, and one plot on Okinawa Island within the natural World Heritage site, and an additional three plots in southern Kyushu using the standardized belt-transect survey method during July 2012 to October 2020. The dataset includes 99 families, 215 genera, and 380 species of vascular plants, and provides species occurrence among 10 subplots for all vascular plants, girth at breast height (GBH) and height of all trees and climbers with GBH ≥ 3.2 cm or height ≥ 4 m in each 5 × 100 m plot. This dataset serves as baseline data for subsequent plant diversity monitoring of the natural World Heritage site. This dataset is published as a data paper in Ecological Research (see https://doi.org/10.1111/1440-1703.12340).

データ レコード

この sampling event リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、121 レコードが含まれています。

拡張データ テーブルは2 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

Event (コア)
121
ExtendedMeasurementOrFact 
6426
Occurrence 
5301

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

National Institute for Environmental Studies (2022) The baseline dataset for plant diversity monitoring of World Natural Heritage site on Amami-Oshima Island, Tokunoshima Island and Northern part of Okinawa Island. Version 1. National Institute for Environmental Studies. Dataset/Sampling-event.

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は National Institute of Genetics, ROIS。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0 License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: a51f47ec-f320-4bd4-a8d6-fc75732bfce2が割り当てられています。   GBIF Japan によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているNational Institute of Genetics, ROIS が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

Samplingevent; Amami islands; biodiversity; community structure; Kagoshima; Ryukyu islands; Samplingevent

連絡先

Toyama Hironori
  • 論文著者
Research Associate
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Shuichiro Tagane
  • 論文著者
Assistant Professor
The Kagoshima University Museum, Kagoshima University
1-21-30 Korimoto
890-0065 Kagoshima
Kagoshima
JP
Kumiko Totsu
  • 論文著者
Specialist (Database engineer)
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Kengo Fuse
  • 論文著者
Director
Kyushu Open University
744 Motooka
819-0395 Fukuoka
Fukuoka
JP
Nariko Toyama
  • 論文著者
Assistant Staff
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Biodiversity Division
  • 連絡先
National Institute for Environmental Studies
JP
Shin Ugawa
  • 論文著者
Associate Professor
Kagoshima University
1-21-24 Korimoto
890-8580 Kagoshima
Kagoshima
JP
Shin-ichiro Aiba
  • 論文著者
Professor
Hokkaido University
N10 W5 Kita-ku
060-0810 Sapporo
Sapporo
JP
Eizi Suzuki
  • 論文著者
Specially Appointed Professor
Kagoshima University
1-21-24 Korimoto
890-8580 Kagoshima
Kagoshima
JP
Taku Kadoya
  • 論文著者
Head
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Atsushi Takashima
  • 論文著者
Assistant Professor
University of the Ryukyus
685 Yona
905-1427 Kunigami
Okinawa
JP
Yayoi Takeuchi
  • メタデータ提供者
  • 論文著者
  • 最初のデータ採集者
  • 連絡先
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Kaito Yamazaki
  • 論文著者
Kagoshima University
1-21-24 Korimoto
890-8580 Kagoshima
Kagoshima
JP

地理的範囲

Kagoshima and Okinawa prefecture, Japan

座標(緯度経度) 南 西 [26, 128], 北 東 [33, 132]

生物分類学的範囲

99 families, 215 genera and 381 species of vascular plants

Family Acanthaceae, Actinidiaceae, Adoxaceae, Anacardiaceae, Apocynaceae, Aquifoliaceae, Araceae, Araliaceae, Aristolochiaceae, Asparagaceae, Aspleniaceae, Asteraceae, Athyriaceae, Blechnaceae, Cannabaceae, Caprifoliaceae, Celastraceae, Chloranthaceae, Cibotiaceae, Colchicaceae, Commelinaceae, Convolvulaceae, Cucurbitaceae, Cyatheaceae, Cyperaceae, Daphniphyllaceae, Davalliaceae, Dennstaedtiaceae, Dipteridaceae, Dryopteridaceae, Ebenaceae, Elaeagnaceae, Elaeocarpaceae, Ericaceae, Euphorbiaceae, Fabaceae, Fagaceae, Garryaceae, Gentianaceae, Gesneriaceae, Gleicheniaceae, Hamamelidaceae, Helwingiaceae, Hydrangeaceae, Hymenophyllaceae, Iteaceae, Lamiaceae, Lardizabalaceae, Lauraceae, Lindsaeaceae, Loganiaceae, Lycopodiaceae, Marattiaceae, Melanthiaceae, Melastomataceae, Menispermaceae, Mitrastemonaceae, Moraceae, Myricaceae, Myrtaceae, Nephrolepidaceae, Oleaceae, Ophioglossaceae, Orchidaceae, Pentaphylacaceae, Phyllanthaceae, Piperaceae, Plagiogyriaceae, Poaceae, Podocarpaceae, Polygonaceae, Polypodiaceae, Primulaceae, Proteaceae, Psilotaceae, Pteridaceae, Ranunculaceae, Rosaceae, Rubiaceae, Rutaceae, Sabiaceae, Salicaceae, Schisandraceae, Schoepfiaceae, Selaginellaceae, Smilacaceae, Solanaceae, Staphyleaceae, Stemonaceae, Styracaceae, Symplocaceae, Taxaceae, Tectariaceae, Theaceae, Thelypteridaceae, Urticaceae, Violaceae, Vitaceae, Zingiberaceae

時間的範囲

開始日 / 終了日 2012-07-01 / 2020-10-24

プロジェクトデータ

説明がありません

タイトル 1. Climate Change Adaptation Research Program; 2. Scientific Research on Priority Areas (on Island Research)
ファンデイング 1. National Institute for Environmental Studies, Japan; 2. Kagoshima University

プロジェクトに携わる要員:

Eizi Suzuki *2
Hironori Toyama *1
Nariko Toyama *1
Shuichiro Tagane *2
Kaito Yamazaki *2
Taku Kadoya *1
Yayoi Takeuchi *1
Kumiko Totsu *1

収集方法

We placed a rectangular plot (5 × 100 m) and divided it into 10 subplots (5 × 10 m) in which all vascular plant species were listed and all stems of a certain height and GBH were recorded. The plot was marked with GPS coordinates noting the beginning and ending points using GPSMAP 64SC (Garmin Ltd.). Stems with girth at breast height (GBH) ≥3.2 cm in Plots A–G and I and stem heights taller than 4 m in Plots H, J, and K were recorded. Tree height was assessed by visual estimation, and GBH was measured using a measuring tape. To calibrate the visual estimates of tree height, we sometimes used a 15 m carbon pole (CAH04-015S, Taketani Trading Co., Ltd.) to round to the nearest 0.5 m. As two individuals of Quercus glauca Thun. var. amamiana (Hatus.) Hatus. ex H.Ohba in Plot F had many basal shoots (53 and 24, respectively), we measured all shoots with GBH ≥ 10 cm and randomly selected five shoots with GBH ≥ 3.2 cm but smaller than 10 cm, thus, the data contains the occurrence of all shoots with GBH ≥ 3.2 cm, and GBH and height of all shoots with GBH ≥ 10 cm and of five shoots with GBH ≥ 3.2 cm but smaller than 10 cm.

Study Extent The data were obtained from evergreen broadleaf forests at four, three, one and three locations on Amami-Ohisma island, Tokunoshima island, Okinawa island, and southern Kyushu with a nearby island (Shimokoshiki), respectively.
Quality Control Species identification was performed in the field and recorded in Japanese common names. The plant nomenclature followed the YList (Yonekura & Kajita 2003–) and spelling of scientific names were checked against the GBIF Backbone Taxonomy (GBIF Secretariat 2021). When we found an inconsistency of taxonomic treatment between two databases, we followed YList (Yonekura & Kajita, 2003–). Most plants were identified to species-level including subspecies and varieties, but seven taxa, Carex sp. 1 and 2, Calanthe sp. 1, Trichosanthes sp. 1, Goodyera sp. 1, Malaxis sp. 1 Lycianthes cf. biflora (Lour.) Bitter and Asarum cf. simile Hatus., were unidentified due to its lacking reproductive organs which are important for their classification. The species identification level and the doubts of the identification were mentioned in “taxonRank” and “identificationQualifier,” respectively

Method step description:

  1. Geographic coordinates are generalized to six representative points (A-D, E-G, H, I, J, K) with an uncertainty radius of 10 km, since exact coordinates of the study plots are not provided for conservation reasons.

書誌情報の引用

  1. Yonekura K, Kajita T (2003–) BG Plants: index for Japanese scientific plant names: Ylist. .
  2. GBIF Secretariat (2021) GBIF Backbone Taxonomy. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/39omei accessed via GBIF.org on 2021-06-03. 10.15468/39omei

追加のメタデータ

代替識別子 a51f47ec-f320-4bd4-a8d6-fc75732bfce2
https://www.gbif.jp/ipt/resource?r=nies_otskplants