Evento de muestreo

A dataset for vascular plant diversity monitoring for the natural World Heritage site on Amami-Oshima Island, Tokunoshima Island, and the northern Okinawa Island

Última versión Publicado por National Institute of Genetics, ROIS en 27 de julio de 2022 National Institute of Genetics, ROIS
Fecha de publicación:
27 de julio de 2022
Licencia:
CC-BY 4.0

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Descripción

This dataset presents the vascular plant biodiversity sampled from four plots on Amami-Oshima Island, three plots on Tokunoshima Island, and one plot on Okinawa Island within the natural World Heritage site, and an additional three plots in southern Kyushu using the standardized belt-transect survey method during July 2012 to October 2020. The dataset includes 99 families, 215 genera, and 380 species of vascular plants, and provides species occurrence among 10 subplots for all vascular plants, girth at breast height (GBH) and height of all trees and climbers with GBH ≥ 3.2 cm or height ≥ 4 m in each 5 × 100 m plot. This dataset serves as baseline data for subsequent plant diversity monitoring of the natural World Heritage site. This dataset is published as a data paper in Ecological Research (see https://doi.org/10.1111/1440-1703.12340).

Registros

Los datos en este recurso de evento de muestreo han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 121 registros.

también existen 2 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

Event (core)
121
ExtendedMeasurementOrFact 
6426
Occurrence 
5301

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

National Institute for Environmental Studies (2022) The baseline dataset for plant diversity monitoring of World Natural Heritage site on Amami-Oshima Island, Tokunoshima Island and Northern part of Okinawa Island. Version 1. National Institute for Environmental Studies. Dataset/Sampling-event.

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es National Institute of Genetics, ROIS. Este trabajo está autorizado bajo una Licencia Creative Commons Atribución/Reconocimiento 4.0 Internacional (CC-BY) 4.0.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: a51f47ec-f320-4bd4-a8d6-fc75732bfce2.  National Institute of Genetics, ROIS publica este recurso y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por GBIF Japan.

Palabras clave

Samplingevent; Amami islands; biodiversity; community structure; Kagoshima; Ryukyu islands; Samplingevent

Contactos

Toyama Hironori
  • Autor
Research Associate
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Shuichiro Tagane
  • Autor
Assistant Professor
The Kagoshima University Museum, Kagoshima University
1-21-30 Korimoto
890-0065 Kagoshima
Kagoshima
JP
Kumiko Totsu
  • Autor
Specialist (Database engineer)
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Kengo Fuse
  • Autor
Director
Kyushu Open University
744 Motooka
819-0395 Fukuoka
Fukuoka
JP
Nariko Toyama
  • Autor
Assistant Staff
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Biodiversity Division
  • Punto De Contacto
National Institute for Environmental Studies
JP
Shin Ugawa
  • Autor
Associate Professor
Kagoshima University
1-21-24 Korimoto
890-8580 Kagoshima
Kagoshima
JP
Shin-ichiro Aiba
  • Autor
Professor
Hokkaido University
N10 W5 Kita-ku
060-0810 Sapporo
Sapporo
JP
Eizi Suzuki
  • Autor
Specially Appointed Professor
Kagoshima University
1-21-24 Korimoto
890-8580 Kagoshima
Kagoshima
JP
Taku Kadoya
  • Autor
Head
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Atsushi Takashima
  • Autor
Assistant Professor
University of the Ryukyus
685 Yona
905-1427 Kunigami
Okinawa
JP
Yayoi Takeuchi
  • Proveedor De Los Metadatos
  • Autor
  • Originador
  • Punto De Contacto
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Kaito Yamazaki
  • Autor
Kagoshima University
1-21-24 Korimoto
890-8580 Kagoshima
Kagoshima
JP

Cobertura geográfica

Kagoshima and Okinawa prefecture, Japan

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [26, 128], Latitud Máxima Longitud Máxima [33, 132]

Cobertura taxonómica

99 families, 215 genera and 381 species of vascular plants

Familia Acanthaceae, Actinidiaceae, Adoxaceae, Anacardiaceae, Apocynaceae, Aquifoliaceae, Araceae, Araliaceae, Aristolochiaceae, Asparagaceae, Aspleniaceae, Asteraceae, Athyriaceae, Blechnaceae, Cannabaceae, Caprifoliaceae, Celastraceae, Chloranthaceae, Cibotiaceae, Colchicaceae, Commelinaceae, Convolvulaceae, Cucurbitaceae, Cyatheaceae, Cyperaceae, Daphniphyllaceae, Davalliaceae, Dennstaedtiaceae, Dipteridaceae, Dryopteridaceae, Ebenaceae, Elaeagnaceae, Elaeocarpaceae, Ericaceae, Euphorbiaceae, Fabaceae, Fagaceae, Garryaceae, Gentianaceae, Gesneriaceae, Gleicheniaceae, Hamamelidaceae, Helwingiaceae, Hydrangeaceae, Hymenophyllaceae, Iteaceae, Lamiaceae, Lardizabalaceae, Lauraceae, Lindsaeaceae, Loganiaceae, Lycopodiaceae, Marattiaceae, Melanthiaceae, Melastomataceae, Menispermaceae, Mitrastemonaceae, Moraceae, Myricaceae, Myrtaceae, Nephrolepidaceae, Oleaceae, Ophioglossaceae, Orchidaceae, Pentaphylacaceae, Phyllanthaceae, Piperaceae, Plagiogyriaceae, Poaceae, Podocarpaceae, Polygonaceae, Polypodiaceae, Primulaceae, Proteaceae, Psilotaceae, Pteridaceae, Ranunculaceae, Rosaceae, Rubiaceae, Rutaceae, Sabiaceae, Salicaceae, Schisandraceae, Schoepfiaceae, Selaginellaceae, Smilacaceae, Solanaceae, Staphyleaceae, Stemonaceae, Styracaceae, Symplocaceae, Taxaceae, Tectariaceae, Theaceae, Thelypteridaceae, Urticaceae, Violaceae, Vitaceae, Zingiberaceae

Cobertura temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2012-07-01 / 2020-10-24

Datos del proyecto

No hay descripción disponible

Título 1. Climate Change Adaptation Research Program; 2. Scientific Research on Priority Areas (on Island Research)
Fuentes de Financiación 1. National Institute for Environmental Studies, Japan; 2. Kagoshima University

Personas asociadas al proyecto:

Eizi Suzuki *2
Hironori Toyama *1
Nariko Toyama *1
Shuichiro Tagane *2
Kaito Yamazaki *2
Taku Kadoya *1
Yayoi Takeuchi *1
Kumiko Totsu *1

Métodos de muestreo

We placed a rectangular plot (5 × 100 m) and divided it into 10 subplots (5 × 10 m) in which all vascular plant species were listed and all stems of a certain height and GBH were recorded. The plot was marked with GPS coordinates noting the beginning and ending points using GPSMAP 64SC (Garmin Ltd.). Stems with girth at breast height (GBH) ≥3.2 cm in Plots A–G and I and stem heights taller than 4 m in Plots H, J, and K were recorded. Tree height was assessed by visual estimation, and GBH was measured using a measuring tape. To calibrate the visual estimates of tree height, we sometimes used a 15 m carbon pole (CAH04-015S, Taketani Trading Co., Ltd.) to round to the nearest 0.5 m. As two individuals of Quercus glauca Thun. var. amamiana (Hatus.) Hatus. ex H.Ohba in Plot F had many basal shoots (53 and 24, respectively), we measured all shoots with GBH ≥ 10 cm and randomly selected five shoots with GBH ≥ 3.2 cm but smaller than 10 cm, thus, the data contains the occurrence of all shoots with GBH ≥ 3.2 cm, and GBH and height of all shoots with GBH ≥ 10 cm and of five shoots with GBH ≥ 3.2 cm but smaller than 10 cm.

Área de Estudio The data were obtained from evergreen broadleaf forests at four, three, one and three locations on Amami-Ohisma island, Tokunoshima island, Okinawa island, and southern Kyushu with a nearby island (Shimokoshiki), respectively.
Control de Calidad Species identification was performed in the field and recorded in Japanese common names. The plant nomenclature followed the YList (Yonekura & Kajita 2003–) and spelling of scientific names were checked against the GBIF Backbone Taxonomy (GBIF Secretariat 2021). When we found an inconsistency of taxonomic treatment between two databases, we followed YList (Yonekura & Kajita, 2003–). Most plants were identified to species-level including subspecies and varieties, but seven taxa, Carex sp. 1 and 2, Calanthe sp. 1, Trichosanthes sp. 1, Goodyera sp. 1, Malaxis sp. 1 Lycianthes cf. biflora (Lour.) Bitter and Asarum cf. simile Hatus., were unidentified due to its lacking reproductive organs which are important for their classification. The species identification level and the doubts of the identification were mentioned in “taxonRank” and “identificationQualifier,” respectively

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. Geographic coordinates are generalized to six representative points (A-D, E-G, H, I, J, K) with an uncertainty radius of 10 km, since exact coordinates of the study plots are not provided for conservation reasons.

Referencias bibliográficas

  1. Yonekura K, Kajita T (2003–) BG Plants: index for Japanese scientific plant names: Ylist. .
  2. GBIF Secretariat (2021) GBIF Backbone Taxonomy. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/39omei accessed via GBIF.org on 2021-06-03. 10.15468/39omei

Metadatos adicionales

Identificadores alternativos a51f47ec-f320-4bd4-a8d6-fc75732bfce2
https://www.gbif.jp/ipt/resource?r=nies_otskplants