データ登録までの流れ

お問い合わせからGBIFへの登録までの流れ

データをお持ちの方はお問い合わせください

データをお持ちでGBIFへのデータ登録をご検討の方は、 こちらのフォームからお問い合わせください。後日、担当からご連絡差し上げます。

JBIFでは、原則、機関・組織が所有するデータのみ受け付けております。

データを登録できる形に整えます

GBIFにデータを登録するためには、データを決まった形式に整える必要があります。以下に形式や必須項目などについてまとめていますが、登録されるデータが標本データで、 S-Netにも登録される場合はこれ以外にも必要な項目があります。また、データは基本的に英語で登録しますので、英語でご準備ください。ご不明な点や詳細については担当にご相談ください。

データをどのタイプのデータセットとして公開するかを選択します

データセットのタイプは4種類あります。

データセットのタイプ適しているデータ登録に必要なデータ
メタデータ自然史コレクションなど、現在デジタル化されていないデータをお持ちの場合。
チェックリスト種のチェックリストをお持ちの場合。情報が豊富な場合はオカレンスデータセットとして登録することをお勧めします。
チェックリストデータ
オカレンス標本データや観測データなど、ある種がある場所に存在した証拠となるデータをお持ちの場合。
オカレンスデータ
サンプリングイベントモニタリングデータなど、決まった手法で集めた、複数の時間・場所のデータをお持ちの場合。サンプリング手法に関する情報を記したファイルを紐づけることができます。
オカレンスデータ
イベントデータ

各データセットタイプの詳細については、GBIFの Dataset classes や、 ライブラリー-データ公開の方法 をご覧ください。

登録に必要なデータの概要

データについての情報をまとめたデータ。タイトル、説明、連絡先等の情報が必須です(必要な情報の詳細は へ)。

チェックリストデータ

チェックリストのデータ。taxonID、学名、分類の階級の情報が必須です(必要な情報の詳細は へ)。

オカレンスデータ

ある種がある場所に存在した証拠となるデータ。occurrenceID、データがどのような性質のものか(例えば、保存標本、人による観察など)、学名、存在した日時の情報が必須です(必要な情報の詳細は へ)。

イベントデータ

サンプリングに関するデータ。eventID、イベントの日時、サンプリング手法の情報が必須です(必要な情報の詳細は へ)。

メタデータを準備します

メタデータは4つのすべてのデータセットで必要になる、データについてのデータであり、そのデータセットの種類(観察または標本)やデータセットの担当者の所属や連絡先、データ採取地の情報(いつ、緯度・経度などの場所、対象生物種の系統情報など)、 関連する文献情報などについて記載します。 GBIFメタデータのページで、メタデータの各項目の説明と、入力例として国立環境研究所の魚類データのメタデータ情報をご覧いただけます。

このほか、登録できるメタデータ項目については GBIFメタデータをご覧ください。

データを Darwin Core 標準形式に合わせます

Darwin core は GBIF で採用されている標準データ形式です。 Darwin core については、GBIF の What is Darwin Core, and why does it matter? をご覧ください。 また、登録できる Darwin core 項目を知りたい場合は、 GBIF Repository of Schemas が便利です。 チェックリストデータの項目は Darwin Core Taxon、 オカレンスデータの項目は Darwin Core Occurrence、 イベントデータの項目は Darwin Core Event をご覧ください。

チェックリストデータ、オカレンスデータ、サンプリングイベントデータのそれぞれに、必須となる Darwin Core 項目があります。各データの必須項目・推奨項目のリストは以下の表をご覧ください。また、GBIFの Data quality requirements にも、求められるデータの品質について書かれています。

このほか、なるべく多くの情報が含まれるように、データを充実させてください。

データセットのタイプがチェックリストの場合
チェックリストデータ
必須項目-必ず登録してください
Darwin core内容
taxonID
scientificName
taxonRank

チェックリストデータセットのテンプレート(エクセルファイル)を こちらのページ の「Templates」からダウンロードできます。「Excel Template (with example data)」にはサンプルデータが入力されています。


データセットのタイプがオカレンスの場合
オカレンスデータ
必須項目-必ず登録してください
Darwin core内容
occurrenceID
basisOfRecord
scientificName
eventDate

オカレンスデータセットのテンプレート(エクセルファイル)を こちらのページ の「Templates」からダウンロードできます。「Excel Template (with example data)」にはサンプルデータが入力されています。


データセットのタイプがサンプリングイベントの場合
オカレンスデータ
必須項目-必ず登録してください
Darwin core内容
eventID
occurrenceID
basisOfRecord
scientificName
イベントデータ
必須項目-必ず登録してください
Darwin core内容
eventID
eventDate

サンプリングイベントデータセットのテンプレート(エクセルファイル)を こちらのページ の「Templates」からダウンロードできます。「Excel Template (with example data)」にはサンプルデータが入力されています。

GBIFに登録します

データが登録できる形に整いましたら、国立科学博物館または国立遺伝学研究所からGBIFにデータセットを登録します。