Occurrence

Microbial Culture Collection, National Institute for Environmental Studies

Последняя версия опубликована National Institute of Genetics, ROIS 12 апреля 2024 г. National Institute of Genetics, ROIS
Домой:
Ссылка
Дата публикации:
12 апреля 2024 г.
Опубликовано:
National Institute of Genetics, ROIS
Лицензия:
CC-BY 4.0

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 1 447 Записи в English (94 KB) - Частота обновления: annually
Метаданные в формате EML Скачать в English (90 KB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (18 KB)

Описание

This dataset provides 1447 occurrence data of algae in the Microbial Culture Collection at the National Institute for Environmental Studies, Japan (NIES Collection) where culture strains of cyanobacteria, eukaryotic microalgae, protozoa and endangered algae are maintained. The NIES Collection can be found at https://mcc.nies.go.jp/localeAction.do?lang=en.

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 1 447 записей.

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Как оформить ссылку

Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:

National Institute for Environmental Studies (2024) Microbial Culture Collection, National Institute for Environmental Studies. 1447 records, Contributed by Tanabe Y, Ishimoto M, Totsu K, Kawachi M, Online:http://www.gbif.jp/ipt/archive.do?r=nies_mcc, under CC BY 4.0.

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является National Institute of Genetics, ROIS. Эта работа находится под лицензией Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0).

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: c26bed28-1ac2-4c07-a18e-c801f3f188c1.  National Institute of Genetics, ROIS отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке GBIF Japan.

Ключевые слова

Specimen; algae; culture collection; Occurrence

Контакты

Yuuhiko Tanabe
  • Content Provider
  • Metadata Provider
  • Originator
  • Point Of Contact
Chief Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Miwa Ishimoto
  • Content Provider
  • Originator
Expert (Curator)
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Kumiko Totsu
  • Programmer
  • Originator
Expert (Database engineer)
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Masanobu Kawachi
  • Content Provider
  • Originator
Specially appointed researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Biodiversity Division
  • Point Of Contact
National Institute for Environmental Studies

Географический охват

Japan, International waters

Ограничивающие координаты Юг Запад [24,049, -167,367], Север Восток [65,833, 147,25]

Таксономический охват

Описание отсутсвует

Genus Acaryochloris, Achnanthes, Achnanthidium, Actinastrum, Aduncisulcus, Aegagropila, Amphidinium, Annamia, Aphanizomenon, Aphanothece, Asterococcus, Asterodinium, Astrephomene, Asulcocephalium, Aulacoseira, Aurearena, Basichlamys, Bathycoccus, Braarudosphaera, Bumilleriopsis, Calcidiscus, Calyptrosphaera, Carolibrandtia, Carteria, Chaetoceros, Chaetopeltis, Chara, Characiochloris, Chattonella, Chlamydomonas, Chlorella, Chlorogonium, Chloromonas, Chloroparvula, Chloropicon, Chlorotetraedron, Choricystis, Chroodactylon, Chroomonas, Chrysamoeba, Chrysochromulina, Chrysophaeum, Chrysotila, Closterium, Coccolithus, Coccomyxa, Coelastrum, Colemanosphaera, Coleochaete, Coolia, Corisphaera, Corynoplastis, Cosmarium, Craticula, Cruciplacolithus, Cryptoglena, Cryptomonas, Cuspidothrix, Cyanobium, Cyanophora, Cyclostephanos, Cyclotella, Cylindrotheca, Dangeardinia, Desmodesmus, Developayella, Dicrateria, Didymogenes, Dinobryon, Diphylleia, Diplophrys, Dolichospermum, Dysnectes, Echinosphaeridium, Emiliania, Entamoeba, Eremosphaera, Esquamula, Euastrum, Eudorina, Euglena, Fibrocapsa, Fischerella, Florenciella, Fragilaria, Fukuyoa, Gambierdiscus, Gephyrocapsa, Gertia, Glaucocystis, Glenodiniopsis, Gloeomonas, Glossomastix, Gonatozygon, Goniomonas, Gonium, Gonyostomum, Gungnir, Gymnoxanthella, Hafniomonas, Hamakko, Hapalochloris, Haptolina, Helicosphaera, Hemidinium, Hemiselmis, Hemistasia, Heterocapsa, Heterosigma, Hyalotheca, Hydrococcus, Hymenomonas, Imantonia, Ixipapillifera, Karenia, Koshicola, Lagerheimia, Lagynion, Leiocephalium, Lepidodinium, Lithodesmium, Lobomonas, Mataza, Mayamaea, Medakamo, Merotricha, Mesostigma, Messastrum, Micractinium, Micrasterias, Microcystis, Microseira, Minidiscus, Monactinus, Monomastix, Monoraphidium, Mychonastes, Nannochloris, Nemalionopsis, Neochlorosarcina, Neodesmus, Nephroselmis, Nitella, Nitellopsis, Nitzschia, Nostoc, Ochrosphaera, Olisthodiscus, Oltmannsiellopsis, Oolithotus, Ophiocytium, Ostravamonas, Ostreococcus, Ovaloplaca, Ovulinata, Pandorina, Parachlorella, Paraphysomonas, Parietochloris, Pascherina, Paulinella, Pavlomulina, Pediastrum, Pediludiella, Pedinella, Pedinomonas, Pelagodinium, Pelagomonas, Penium, Peridinium, Phaeocystis, Picochlorum, Placidia, Planktothricoides, Planktothrix, Planothidium, Pleodorina, Prasinoderma, Prorocentrum, Protosiphon, Prymnesium, Pseudanabaena, Pseudocarteria, Pseudomarvania, Pseudopediastrum, Pseudoschroederia, Pterosperma, Pycnococcus, Pyramimonas, Pyrobotrys, Raphidiophrys, Raphidiopsis, Rhysamphichloris, Rufusiella, Rusalka, Sellaphora, Skeletonema, Sphaerospermopsis, Spinoclosterium, Spirogyra, Staurastrum, Stauridium, Staurodesmus, Staurosirella, Stichococcus, Stigeoclonium, Suigetsumonas, Synechococcus, Synura, Syracosphaera, Tabris, Tetrabaena, Tetradesmus, Tetraselmis, Tetrastrum, Thalassiosira, Thoracosphaera, Thorea, Trachyrhizium, Trebouxia, Trentepohlia, Treubaria, Triparma, Triploceras, Tsukubamonas, Ulnaria, Ulothrix, Umbilicosphaera, Umezakia, Urgorri, Ventrifissura, Viridiuvalis, Vitreochlamys, Volvox, Volvulina, Yamagishiella

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 1964-07-30 / 2022-06-08

Методы сбора

n/a

Охват исследования Algae found in Japan from 1964 to 2022.
Контроль качества Scientific names were validated against AlgaeBase and the GBIF Backbone Taxonomy. Geographic coordinates provided by collectors and depositors or derived from documents of strain deposit requests in the NIES Collection were checked on Google Maps to see whether the coordinates were within the areas of localities.

Описание этапа методики:

  1. Geographic coordinates and uncertainties were measured using gazetteers such as Google Maps and Google Earth 7.1.2.2041 following procedures described in Chapman and Wieczorek (2006). The center of a locality area calculated with ArcGIS 10 was selected as a representative point for localities where exact coordinates were not provided. Geographic data including polygons, lines and points according to the National Land Numerical Information download service (Ministry of Land, Infrastructure, Transport and Tourism, Japan 2005a, 2005b, 2015), Arc GIS data collection 2012 and the literature (Tanaka 2004) were used for calculation. A centroid of a municipality instead of the exact location is used as a generalized locality for endangered algae species. For a municipality consisting of islands, the main island is used to represent the municipality.
  2. Algae strain data were extracted from the Microbial Culture Collection and organized into occurrence data using a MySQL database.

Библиографические ссылки

  1. Chapman, A.D. and Wieczorek, J. (Eds) (2006) Guide to Best Practices for Georeferencing. Global Biodiversity Information Facility, Copenhagen, 90 pp.
  2. Ministry of Land, Infrastructure, Transport and Tourism, Japan (2005a) National Land Numerical Information Lakes Data, Online:http://nlftp.mlit.go.jp/ksj-e/gml/datalist/KsjTmplt-W09.html, accessed on 16/04/2014.
  3. Ministry of Land, Infrastructure, Transport and Tourism, Japan (2005b) National Land Numerical Information Dam Data, Online: http://nlftp.mlit.go.jp/ksj-e/gml/datalist/KsjTmplt-W01.html, accessed on 16/04/2014.
  4. Ministry of Land, Infrastructure, Transport and Tourism, Japan (2015) National Land Numerical Information Administrative Zones Data, Online: http://nlftp.mlit.go.jp/ksj/gml/datalist/KsjTmpltN03.html, accessed on 13/11/2015.
  5. Tanaka M (2004) Nihon Koshoshi II, the University of Nagoya Press, Nagoya.

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы c26bed28-1ac2-4c07-a18e-c801f3f188c1
https://gbif.jp/ipt/resource?r=nies_mcc