Forest monitoring data of 45 plots over the Japanese archipelago during the period of 1980-2021

Données d'échantillonnage
Dernière version Publié par National Institute of Genetics, ROIS le avr. 1, 2024 National Institute of Genetics, ROIS
Date de publication:
1 avril 2024
Licence:
CC-BY 4.0

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Description

Long-term monitoring of a forest tree community is a basis for understanding forest structure and dynamics, and for evaluating ecosystem functions such as primary production. Because global climate change has impacted and will change the forest ecosystems from local to global scales, it is essential to document long-term monitoring data of the forests to examine the temporal and geographical trends of forest changes. We here report the monitoring data of 45 forest plots (average area: 0.69 ha) from 27 sites in Japan. The plots are located with latitude ranges from N 32.38 to N 43.36, and with elevation ranges from 8 m to 2453 m above sea level. These plots include both old-growth and secondary forests, and cover various forest biomes, such as warm-temperate evergreen forests, temperate deciduous broadleaved forests, and boreal or sub-alpine coniferous forests. In each plot, all living trees and liana larger than a certain minimum size (basically 15 cm stem girth at breast height) were repeatedly measured, and survival and recruitment of stems were recorded. Monitoring period varies among plots from 5 to 40 years with the average of 17.3 years. The tree measurement data are presented as a format common to that of the preceding Monitoring Sites 1000 Project in Japan, and as a sample-based Darwin Core format. This dataset expands existing open monitoring data of Japanese forests and thereby facilitates further meta-analysis on forest community structures and their changes in relation to climate change and other drivers. This dataset is published as a data paper in Ecological Research (see https://doi.org/10.1111/1440-1703.12457).

Enregistrements de données

Les données de cette ressource données d'échantillonnage ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 337 enregistrements.

2 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

Event (noyau)
337
ExtendedMeasurementOrFact 
224727
Occurrence 
168805

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

National Institute for Environmental Studies (2024) Forest monitoring data of 45 plots over the Japanese archipelago during the period of 1980-2021. Version 1. National Institute for Environmental Studies. Dataset/Sampling-event.

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est National Institute of Genetics, ROIS. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : b471e8c8-237a-4444-b2ef-0d5ba1903ead.  National Institute of Genetics, ROIS publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du GBIF Japan.

Mots-clé

Samplingevent; Plot network; Forest dynamics; Tree species abundance; Stem diameter; Tree demography; Time-line data; Long-term monitoring; Samplingevent

Contacts

Tetsuro Yoshikawa
  • Auteur
  • Créateur
Research Associate
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Kumiko Totsu
  • Auteur
  • Créateur
Specialist (Database engineer)
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Yayoi Takeuchi
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Auteur
  • Créateur
  • Personne De Contact
Senior Researcher
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Taku Kadoya
  • Auteur
  • Créateur
Head
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP
Tsutomu Enoki
  • Auteur
  • Créateur
Kyushu University
Sakae Fujii
  • Auteur
  • Créateur
Tokushima Prefecture Agriculture, Forestry, and Fisheries Technology Support Center
Atsuko S. Fukamachi
  • Auteur
  • Créateur
Tokyo University of Agriculture and Technology
Mitsuru Hirota
  • Auteur
  • Créateur
University of Tsukuba
Kazuhiko Hoshizaki
  • Auteur
  • Créateur
Akita Prefectural University
Naoki Iiyama
  • Auteur
  • Créateur
Tokushima University
Yukio Ishikawa
  • Auteur
  • Créateur
Hirosaki University
Hiroki Itô
  • Auteur
  • Créateur
Hokkaido Research Center, Forestry and Forest Products Research Institute
Hajime Kobayashi
  • Auteur
  • Créateur
Shinshu University
Takashi Kohyama
  • Auteur
  • Créateur
Hokkaido University
Yasuo Konno
  • Auteur
  • Créateur
Obihiro University of Agriculture and Veterinary Medicine
Akifumi Makita
  • Auteur
  • Créateur
Akita Prefectural University
Akira S. Mori
  • Auteur
  • Créateur
The University of Tokyo
Dai Nagamatsu
  • Auteur
  • Créateur
Tottori University
Tohru Nakashizuka
  • Auteur
  • Créateur
Forestry and Forest Products Research Institute
Kanji Namikawa
  • Auteur
  • Créateur
Hokkaido University of Education
Mahoko Noguchi
  • Auteur
  • Créateur
Forestry and Forest Products Research Institute
Michinori Sakimoto
  • Auteur
  • Créateur
Kyoto University
Yoshinobu Ozaki
  • Auteur
  • Créateur
Shimane University
Tatsuyuki Seino
  • Auteur
  • Créateur
University of Tsukuba
Hisashi Sugita
  • Auteur
  • Créateur
Toyama Prefectural Agricultural, Forestry and Fisheries Research Center
Jun-Ichirou Suzuki
  • Auteur
  • Créateur
Tokyo Metropolitan University
Ryo O. Suzuki
  • Auteur
  • Créateur
University of The Ryukyus
Satoshi N. Suzuki
  • Auteur
  • Créateur
The University of Tokyo
Koichi Takahashi
  • Auteur
  • Créateur
Shinshu University
Ryunosuke Tateno
  • Auteur
  • Créateur
Kyoto University
Ryuichi Watanabe
  • Auteur
  • Créateur
Shinshu University
Tamon Yamashita
  • Auteur
  • Créateur
Shimane University
Tomohiro Yoshida
  • Auteur
  • Créateur
Tokyo University of Agriculture and Technology
Masae I. Ishihara
  • Auteur
  • Créateur
Kyoto University
Kenta Tanaka
  • Auteur
  • Créateur
University of Tsukuba
Masahiro Nakamura
  • Auteur
  • Créateur
Hokkaido University
Tsutom Hiura
  • Auteur
  • Créateur
The University of Tokyo
Biodiversity Division
  • Personne De Contact
National Institute for Environmental Studies
16-2 Onogawa
305-8506 Tsukuba
Ibaraki
JP

Couverture géographique

Japan

Enveloppe géographique Sud Ouest [32,377, 131,173], Nord Est [43,361, 144,661]

Couverture taxonomique

Trees and liana of gymnosperm and angiosperm of 232 species from 113 genera of 54 families.

Family Actinidiaceae, Adoxaceae, Anacardiaceae, Apocynaceae, Aquifoliaceae, Araliaceae, Aucubaceae, Betulaceae, Cannabaceae, Celastraceae, Cephalotaxaceae, Cercidiphyllaceae, Clethraceae, Cornaceae, Cupressaceae, Daphniphyllaceae, Diervillaceae, Ebenaceae, Ericaceae, Euphorbiaceae, Eupteleaceae, Fabaceae, Fagaceae, Hamamelidaceae, Hydrangeaceae, Juglandaceae, Lamiaceae, Lardizabalaceae, Lauraceae, Magnoliaceae, Malvaceae, Moraceae, Myricaceae, Oleaceae, Pinaceae, Rhamnaceae, Rosaceae, Rutaceae, Sabiaceae, Salicaceae, Sapindaceae, Schisandraceae, Sciadopityaceae, Simaroubaceae, Stachyuraceae, Staphyleaceae, Styracaceae, Symplocaceae, Taxaceae, Ternstroemiaceae, Theaceae, Trochodendraceae, Ulmaceae, Vitaceae

Couverture temporelle

Epoque de formation 1980-2021

Méthodes d'échantillonnage

Tree measurement was performed generally based on the protocol of the Monitoring Site 1000 project (Ishihara et al. 2011). All living trees and liana larger than a certain minimum size were repeatedly measured using a tape measure or a caliper. Minimum size of measured stem (in girth at breast height [GBH] or tree height) differs among the plots, but all the stems with greater than or equal to 15.7 cm in GBH (5 cm in DBH) were measured, except one plot with the minimum size of 31.4 cm of GBH (10 cm in DBH; PL18). Survival and recruitment of stems were also recorded in each census. Total number of censuses per plot ranges from 2 to 23, with the average of 6.0.

Etendue de l'étude The 45 forest plots (coded as PL01–PL45 in this paper) are distributed throughout the Japanese archipelago. Plot latitude ranges from N 32.38 to N 43.36, and longitude ranges from E 131.17 to E 144.66. Elevation of the plots range from 8 m to 2453 m above sea level. Monitoring period per plot ranges from 5 to 40 years and the average is 17.3 years. Total monitoring period ranges from 1980 to 2021. A total of 269 censuses were performed in all the 45 plots. Plot size ranges from 0.0325 ha (plot ID: PL41) to 6.25 ha (plot ID: PL18), with an average of 0.69 ha. Most of the plots have rectangle shapes, but one plot has an irregular shape, and two plots have rectangle outlines but have non-covered areas inside them. These plots were all established in natural forests without cultivated or planted trees, and have experienced no large natural or anthropogenic disturbance (e.g., logging) during the monitoring. Some plots have suffered from insect damage (mainly the oak wilt disease by a bark beetle), deer browsing, or windstorm damage during their monitoring periods. The 45 plots can be categorized into two forest age classes; old-growth forest which had persisted at least 150 years without large disturbances until the start of monitoring (28 plots in 18 sites), and secondary forests, which have established within 150 years before the start of monitoring (17 plots in 11 sites).
Contrôle qualité All plants were identified to species-level by the experts. Scientific names followed the YList (Yonekura and Kajita 2003) and were checked against the GBIF Backbone Taxonomy (GBIF Secretariat 2021).

Description des étapes de la méthode:

  1. Tree census data was formatted into event data. A plot ID was stored in locationID. When a census date was not available, a date range based on the Japanese fiscal year was provided in eventDate.
  2. For the measurement in which individuals were identified, occurrence data was extracted from the GBH measurement data by a combination of a plot ID, an individual identification code (*case-sensitive), a census date, and species. A combination of a plot ID and an individual identification code was stored in organismID. For the measurement in which individuals were not identified (i.e. some in PL18 and all in PL02, PL05 and PL40), a combination of a plot ID, a census date, and species was used to extract occurrence data and therefore organismID was not provided.
  3. Measurement records including GBH and the proportion of tree trunk area where bark is stripped by deers, were created for each stem observed.

Citations bibliographiques

  1. Ishihara MI, Suzuki SN, Nakamura M, et al (2011) Forest stand structure, composition, and dynamics in 34 sites over Japan. Ecol Res 26:1007 10.1007/s11284-011-0847-y
  2. Yonekura K, Kajita T (2003) BG Plants: Japanese name-Scientific name index (YList). In: Retrieved July. http://ylist.info/
  3. GBIF Secretariat (2021) GBIF Backbone Taxonomy. Checklist dataset https://doi.org/10.15468/39omei accessed via GBIF.org on 2021-08-12. 10.15468/39omei

Métadonnées additionnelles