Darwin Core について
Darwin Coreは、標本、観察データの標準交換形式であり、インターネットを通じてデータ共用するために使用され、GBIFプロジェクトでも採用されています。以下のようにいくつかのバージョンがあり、詳細は XML Schema で定義されています。
- Darwin Core 最新版 ( XML Schema)
- Darwin Core 1.4
- Darwin Core 1.2
Darwin Core最新版の項目
ダーウィンコア項目名 | 説明 | データ例 |
---|---|---|
occurrenceID | 標本・観察データレコードに割り振られるユニークID | urn:lsid:nhm.ku.edu:Herps:32 urn:catalog:FMNH:Mammal:145732 |
type | リソースの性質 | StillImage MovingImage Sound |
modified | データの最終更新日 | 1963-03-08T14:07-0600 2009-02-20T08:40Z 1906-06 1971 2007-03-01T13:00:00Z/2008-05-11T15:30:00Z |
language | リソースの言語 | en ja |
rights | リソースのライセンス | http://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/ |
rightsHolder | リソースのライセンスを保有している個人または機関 | The Regents of the University of California. |
accessRights | データアクセスに関するライセンス情報 | not-for-profit use only |
bibliographicCitation | リソースに関する文献情報 | Ctenomys sociabilis (MVZ 165861) for a specimen |
references | 参照している関連リソース | http://mvzarctos.berkeley.edu/guid/MVZ:Mamm:165861 |
institutionID | 内部で使用している研究機関ID | |
collectionID | コレクションを識別するID。標本データの場合 Biodiversity Collections Index のID | urn:lsid:biocol.org:col:34818 |
datasetID | データセットに付与されるID | urn:lsid:biocol.org:col:34818 |
institutionCode | 研究機関コード | NIG RBRC |
collectionCode | コレクションやデータセットを識別するコード | Mammals Hildebrandt eBird |
datasetName | データセット名 | Grinnell Resurvey Mammals Lacey Ctenomys Recaptures |
ownerInstitutionCode | データ所有者名または略称 | NPS APN InBio |
basisOfRecord | データレコードの種類 | PreservedSpecimen FossilSpecimen LivingSpecimen HumanObservation MachineObservation |
informationWithheld | 追加情報 | location information not given for endangered species collector identities withheld ask about tissue samples |
dataGeneralizations | 測定情報に関する追加情報 | Coordinates generalized from original GPS coordinates to the nearest half degree grid cell |
dynamicProperties | レコードの追加測定情報、事実、特長。キー・バリューペアで記載。 | {"heightInMeters":1.5} {"tragusLengthInMeters":0.014, "weightInGrams":120} {"natureOfID":"expert identification", "identificationEvidence":"cytochrome B sequence"} {"relativeHumidity":28, "airTemperatureInCelsius":22, "sampleSizeInKilograms":10} {"aspectHeading":277, "slopeInDegrees":6} {"iucnStatus":"vulnerable", "taxonDistribution":"Neuquén, Argentina"} |
source | オリジナルサイトのレコードを示すURL | http://ww2.bgbm.org/herbarium/view_large.cfm?SpecimenPK=100611&idThumb=310161&SpecimenSequenz=1&loan=0 |
catalogNumber | コレクション内のユニークID | 2008.1334 145732a 145732 |
occurrenceRemarks | 標本・観察データに関する補足説明 | found dead on road |
recordNumber | 標本・観察データが記録された時のID | OPP 7101 |
recordedBy | 標本・観察データの担当者(のリスト)、グループ、機関 | Oliver P. Pearson; Anita K. Pearson |
individualID | 標本・観察データに責任を持つ個人またはグループ名 | U.amer. 44 Smedley Orca J 23 |
individualCount | 標本収集、観測時点の個体数 | 1 25 |
sex | 標本・観察データの個体の性 | female hermaphrodite 8 males, 4 females Controlled vocaburaryの使用を推奨。 |
lifeStage | 標本・観察データの個体のライフステージ | egg eft juvenile adult 2 adults 4 juveniles Controlled vocaburaryの使用を推奨。 |
reproductiveCondition | 標本・観察データの最生成情報 | non-reproductive pregnant in bloom fruit-bearing |
behavior | 標本・観察データが記録された時の個体の振る舞い | roosting foraging running |
establishmentMeans | 標本もしくは観測データの個体の生成プロセス | cultivated invasive escaped from captivity wild native |
occurrenceStatus | 標本・観察データの観測地における、同一分類種の観測記録の有無 | present absent |
preparations | 標本の準備または保存方法(のリスト) | skin; skull; skeleton whole animal (ETOH); tissue (EDTA) fossil cast photograph DNA extract |
disposition | 現在の標本の状況 | in collection missing voucher elsewhere duplicates elsewhere |
otherCatalogNumbers | ある標本・観察データに以前割り振られたカタログ番号(のリスト) | FMNH:Mammal:1234 NPS YELLO6778; MBG 33424 |
previousIdentifications | previouscatalognumber | previouscatalognumber |
associatedMedia | 標本・観察データに関連する画像ファイルなどのURI(のリスト) | http://arctos.database.museum/SpecimenImages/UAMObs/Mamm/2/P7291179.JPG |
associatedReferences | 標本・観察データに関連する文献情報のIDやURL | http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/322/5899/261 Christopher J. Conroy, Jennifer L. Neuwald. 2008. Phylogeographic study of the California vole, Microtus californicus Journal of Mammalogy, 89(3):755-767. |
associatedOccurrences | ある標本・観察データに関連のある標本・観察データのID | sibling of FMNH:Mammal:1234; sibling of FMNH:Mammal:1235 |
associatedSequences | 標本・観察データに関連づけられた遺伝的配列情報の論文やID(のリスト) | GenBank: U34853.1 |
associatedTaxa | 標本・観察データに関連する分類、系統情報 | host: Quercus alba |
occurrenceDetails | 非推奨項目 | |
eventID | 標本・観察データのイベント情報ID | |
samplingProtocol | 収集方法 | UV light trap mist net bottom trawl ad hoc observation | point count Penguins from space: faecal stains reveal the location of emperor penguin colonies, http://dx.doi.org/10.1111/j.1466-8238.2009.00467.x Takats et al. 2001. Guidelines for Nocturnal Owl Monitoring in North America. Beaverhill Bird Observatory and Bird Studies Canada, Edmonton, Alberta. 32 pp., http://www.bsc-eoc.org/download/Owl.pdf |
samplingEffort | イベント中の作業メモ | 40 trap-nights 10 observer-hours; 10 km by foot; 30 km by car |
eventDate | イベント発生の日時もしくは間隔 | 1963-03-08T14:07-0600 2009-02-20T08:40Z 1809-02-12 1906-06 1971 2007-03-01T13:00:00Z/2008-05-11T15:30:00Z 2007-11-13/15 ISO 8601:2004(E)の使用を推奨。 |
eventTime | イベント発生期間。 | 14:07-0600 is 2:07pm in the time zone six hours earlier than UTC 08:40:21Z is 8:40:21am UTC 13:00:00Z/15:30:00Z is the interval between 1pm UTC and 3:30pm UTC. |
startDayOfYear | イベント開始日。1は1月1日、365は12月31日を示す。 | 1 365 |
endDayOfYear | イベント終了日。1は1月1日、365は12月31日を示す。 | 1 365 |
year | イベント発生年 | 2008 |
month | イベント発生月 | 1 10 |
day | イベント発生日 | 9 28 |
verbatimEventDate | イベント発生日時(フリーテキスト) | spring 1910 Marzo 2002 1999-03-XX 17IV1934 |
habitat | 生息地 | oak savanna pre-cordilleran steppe |
fieldNumber | フィールドにおけるイベントに割り振られるID | RV Sol 87-03-08 |
fieldNotes | 論文のURIやイベントに関するメモ | notes available in Grinnell-Miller Library |
eventRemarks | イベントに関する補足説明 | |
locationID | 採集地ID | |
higherGeographyID | 採集地ID | TGN: 1002002 for Prov. Tierra del Fuego, Argentina |
higherGeography | Locality要素の情報よりもおおまかな標本の採集地名。 | South America | Argentina | Patagonia | Parque Nacional Nahuel Huapi | Neuquén | Los Lagos (with accompanying values South America in Continent, Argentina in Country, Neuquén in StateProvince, and Los Lagos in County. |
continent | 標本採取地・観測地の大陸 | Antarctica ISO3166 Continent Codeの使用推奨。 |
waterBody | 標本採取地・観測地の大洋 | Indian Ocean Baltic Sea Getty Thesaurus of Geographic Namesの使用推奨。 |
islandGroup | 標本採取地・観測地の島群 | Alexander Archipelago Getty Thesaurus of Geographic Namesの使用推奨。 |
island | 標本採取地・観測地の島 | Isla Victoria Getty Thesaurus of Geographic Namesの使用推奨。 |
country | 標本採取地・観測地の国 | Denmark Colombia España Getty Thesaurus of Geographic Namesの使用推奨。 |
countryCode | 国コード | AR for Argentina SV for El Salvador ISO 3166-1-alpha-2 country codesの使用推奨。 |
stateProvince | 標本採取地・観測地の州、県 | Montana Minas Gerais Córdoba |
county | 標本採取地・観測地の群、区 | Missoula Los Lagos Mataró |
municipality | 市名など群よりさらに小さい管理地域名 | Holzminden |
locality | 標本採取地・観測地の説明 | Bariloche, 25 km NNE via Ruta Nacional 40 (=Ruta 237) |
verbatimLocality | 標本採集地・観測地(フリーテキスト) | 25 km NNE Bariloche por R. Nac. 237 |
verbatimElevation | 標本採集地・観測地の最高海抜距離(フリーテキスト) | 100-200 m |
minimumElevationInMeters | 標本採集地・観測地の最低海抜距離(メートル単位) | 100 |
maximumElevationInMeters | 標本採集地・観測地の最高海抜距離(メートル単位) | 200 |
verbatimDepth | 標本採集地・観測地の水深(フリーテキスト) | 100-200 m |
minimumDepthInMeters | 標本採集地・観測地の水面からの最浅の距離(メートル単位) | 100 |
maximumDepthInMeters | 標本採集地・観測地の水面からの最深の距離(メートル単位) | 200 |
minimumDistanceAboveSurfaceInMeters | 参照している海抜表面からのより小さい距離(メートル) | 1.5 meter sediment core from the bottom of a lake (at depth 20m) at 300m elevation; VerbatimElevation: 300m MinimumElevationInMeters: 300 MaximumElevationInMeters: 300 VerbatimDepth: 20m MinimumDepthInMeters: 20 MaximumDepthInMeters: 20 minimumDistanceAboveSurfaceInMeters: 0 maximumDistanceAboveSurfaceInMeters: -1.5 |
maximumDistanceAboveSurfaceInMeters | 参照している海抜表面からのより大きい距離(メートル) | 1.5 meter sediment core from the bottom of a lake (at depth 20m) at 300m elevation; VerbatimElevation: 300m MinimumElevationInMeters: 300 MaximumElevationInMeters: 300 VerbatimDepth: 20m MinimumDepthInMeters: 20 MaximumDepthInMeters: 20 minimumDistanceAboveSurfaceInMeters: 0 maximumDistanceAboveSurfaceInMeters: -1.5 |
locationAccordingTo | 文献などの採集地の情報源 | Getty Thesaurus of Geographic Names GADM |
locationRemarks | 採集地に関する補足説明 | under water since 2005 |
verbatimCoordinates | フリーテキストによるオリジナルの位置 | 41 05 54S 121 05 34W 17T 630000 4833400 |
verbatimLatitude | フリーテキストによるオリジナルの緯度 | 41 05 54.03S |
verbatimLongitude | フリーテキストによるオリジナルの経度 | 121d 10' 34" W |
verbatimCoordinateSystem | verbatimCoordinate, verbatimLatitude, verbatimLongitudeのデータの元になっている座標システム。Controlled vocabularyの使用を推奨。 | decimal degrees degrees decimal minutes degrees minutes seconds UTM |
verbatimSRS | 空間参照システム名 | EPSG:4326 WGS84 NAD27 Campo Inchauspe European 1950 Clarke 1866 |
decimalLatitude | 標本収集地、観測地の緯度。-90~90の数値 | -41.0983423 |
decimalLongitude | 標本収集地、観測地の経度。-180~180の数値 | -121.1761111 |
geodeticDatum | 測地学データ | EPSG:4326 WGS84 NAD27 Campo Inchauspe European 1950 Clarke 1866 |
coordinateUncertaintyInMeters | 標本採集地、観測地の範囲、緯度・経度を囲んだ半径(メートル) | 31 70 |
coordinatePrecision | coordinateprecision | coordinateprecision |
pointRadiusSpatialFit | 緯度・経度の位置の正確さ | 0~1以下の数値。観測地と計測情報が完全に一致する場合1とする。 |
footprintWKT | WKT (Well Known Text)形式の標本採集地、観測地情報 | POLYGON ((10 20, 11 20, 11 21, 10 21, 10 20)) 経度10度、緯度20度から経度11度、緯度21度の場所を示す。 |
footprintSRS | footprintWKTの空間参照システム名 | GEOGCS["GCS_WGS_1984", DATUM["D_WGS_1984", SPHEROID["WGS_1984", 6378137, 298.257223563]], PRIMEM["Greenwich", 0], UNIT["Degree", 0.0174532925199433]] |
footprintSpatialFit | footprintWKTの正確さ | 0~1以下の数値。観測地と計測情報が完全に一致する場合1とする。footprintWKTと計測情報が完全に一致する場合1とする。 |
georeferencedBy | 標本採集地、観測地の地理参照システムを決めた人やグループ名 | Kristina Yamamoto (MVZ); Janet Fang (MVZ) Brad Millen (ROM) |
georeferencedDate | 標本採集地、観測地の地理参照システムの決定日 | 1963-03-08T14:07-0600 |
georeferenceProtocol | 標本採集地、観測地を測定した方法 | Guide to Best Practices for Georeferencing (Chapman and Wieczorek, eds. 2006), Global Biodiversity Information Facility. MaNIS/HerpNet/ORNIS Georeferencing Guidelines BioGeomancer |
georeferenceSources | 標本採集地、観測地を記載するのに使用した地図や地名辞書 | USGS 1:24000 Florence Montana Quad; Terrametrics 2008 on Google Earth |
georeferenceVerificationStatus | 標本採集地、観測地の検証状況。Controlled vocabularyの使用を推奨。 | requires verification verified by collector verified by curator |
georeferenceRemarks | 標本採集地、観測地やその測定方法に関する補足説明 | assumed distance by road (Hwy. 101) |
geologicalContextID | 地層などの地質を示すID | |
earliestEonOrLowestEonothem | 古代生物採集地の最も古い年代または最も低い地層名 | Phanerozoic Proterozoic |
latestEonOrHighestEonothem | 古代生物採集地の最も新しい年代または最も高い地層名 | Phanerozoic Proterozoic |
earliestEraOrLowestErathem | 古代生物採集地の最も古い時代または最も低い地層名 | Cenozoic Mesozoic eraはeonよりも細かい時代を指定する。あるeonが複数のeraに分割される。 |
latestEraOrHighestErathem | 古代生物採集地の最も新しい時代または最も高い地層名 | Cenozoic Mesozoic |
earliestPeriodOrLowestSystem | 古代生物採集地の最も古い時代または最も低い地層名 | Neogene Tertiary Quaternary periodはeraよりも細かい時代を指定する。あるeraが複数のperiodに分割される。 |
latestPeriodOrHighestSystem | 古代生物採集地の最も新しい時代または最も高い地層名 | Neogene Tertiary Quaternary |
earliestEpochOrLowestSeries | 古代生物採集地の最も古い時代または最も低い地層名 | Holocene Pleistocene Ibexian Series epochはperiodよりも細かい時代を指定する。あるperiodが複数のepochに分割される。 |
latestEpochOrHighestSeries | 古代生物採集地の最も新しい時代または最も高い地層名 | Holocene Pleistocene Ibexian Series |
earliestAgeOrLowestStage | 古代生物採集地の最も古い年代または最も低い地層名 | Atlantic Boreal Skullrockian |
latestAgeOrHighestStage | 古代生物採集地の最も新しい年代または最も高い地層名 | Atlantic Boreal Skullrockian |
lowestBiostratigraphicZone | 古代生物採集地の最も低い地層名 | |
highestBiostratigraphicZone | 古代生物採集地の最も高い地層名 | |
lithostratigraphicTerms | 古代生物採集地の石層 | |
group | 古代生物採集地の石層グループ名 | |
formation | 古代生物採集地の石層形成 | Notch Peak Fromation House Limestone Fillmore Formation |
member | 古代生物採集地の石層構成群 | Lava Dam Member Hellnmaria Member |
bed | 古代生物採集地の石層地 | |
identificationID | 学名付与情報のID | |
identifiedBy | 分類情報を定義した人(のリスト)やグループ、組織 | James L. Patton Theodore Pappenfuss; Robert Macey |
dateIdentified | 分類を定義した日時 | 1963-03-08T14:07-0600 2009-02-20T08:40Z 1809-02-12 1906-06 1971 2007-03-01T13:00:00Z/2008-05-11T15:30:00Z 2007-11-13/15 ISO 8601:2004(E)の使用を推奨。 |
identificationReferences | 学名付与情報の参照情報 | Aves del Noroeste Patagonico. Christie et al. 2004. |
identificationRemarks | 学名付与情報の補足説明 | Distinguished between Anthus correndera and Anthus hellmayri based on the comparative lengths of the uñas. |
identificationQualifier | 生物種同定の補足 | For the determination Quercus aff. agrifolia var. oxyadenia identificationQualifier would be aff. agrifolia var. oxyadenia |
identificationVerificationStatus | 生物分類の証明状況 | 0 4 |
typeStatus | 命名タイプ(type status, typified name, publication) | holotype of Ctenomys sociabilis. Pearson O. P., C116and M. I. Christie. 1985. Historia Natural, 5(37):388 |
taxonID | 生物分類ID | 8fa58e08-08de-4ac1-b69c-1235340b7001 32567 http://species.gbif.org/abies_alba_1753 urn:lsid:gbif.org:usages:32567 |
scientificNameID | 学名ID | urn:lsid:ipni.org:names:37829-1:1.3 |
acceptedNameUsageID | 動物または植物で受け入れられている生物分類ID | 8fa58e08-08de-4ac1-b69c-1235340b7001 |
parentNameUsageID | 上位の生物分類のID | |
originalNameUsageID | 元々の学名命名ルールにおける学名ID | http://species.gbif.org/abies_alba_1753 |
nameAccordingToID | 参照先における生物分類ID | |
namePublishedInID | 出版物における生物分類ID | |
taxonConceptID | 生物分類概念のID | |
scientificName | 著者や日付の情報付き学名 | Coleoptera (order) Vespertilionidae (family) Manis (genus) Ctenomys sociabilis (genus + specificEpithet) Ambystoma tigrinum diaboli (genus + specificEpithet + infraspecificEpithet) Roptrocerus typographi (Györfi, 1952) (genus + specificEpithet + scientificNameAuthorship) Quercus agrifolia var. oxyadenia (Torr.) J.T. Howell |
acceptedNameUsage | 動物または植物で受け入れられている生物分類名 | Tamias minimus |
parentNameUsage | 上位の生物分類名 | |
originalNameUsage | 元々の学名命名ルールにおける学名 | |
nameAccordingTo | 参照先における生物分類名 | |
namePublishedIn | 出版物における生物分類名 | |
namePublishedInYear | 学名が出版された年 | 1915 2008 |
higherClassification | セミコロンでつないだ分類階層情報 | Animalia;Chordata;Vertebrata;Mammalia;Theria;Eutheria;Rodentia;Hystricognatha;Hystricognathi;Ctenomyidae;Ctenomyini;Ctenomys |
kingdom | 標本・観察データの界の情報 | Animalia Plantae |
phylum | 標本・観察データの門の情報 | Chordata (phylum) Bryophyta (division) |
class | 標本・観察データの鋼の情報 | Chordata (phylum) Bryophyta (division) |
order | 標本・観察データの目の情報 | Carnivora Monocleales |
family | 標本・観察データの科の情報 | Felidae Monocleaceae |
genus | 標本・観察データの属の情報 | Puma Monoclea |
subgenus | 標本・観察データの亜属の情報 | |
specificEpithet | 標本・観察データの種の情報 | concolor gottschei |
infraspecificEpithet | 標本・観察データの最も低い分類の学名 | concolor oxyadenia sayi |
taxonRank | 標本・観察データの分類名の情報 | subspecies varietas forma species genus |
verbatimTaxonRank | 標本・観察データの分類名(フリーテキスト) | |
scientificNameAuthorship | 標本・観察データの学名の著者や日付 | (Torr.) J.T. Howell (Martinovský) Tzvelev (Györfi, 1952) |
vernacularName | 標本・観察データの一般名または、その国の言語による名前 | Andean Condor Condor Andino American Eagle Gänsegeier |
nomenclaturalCode | 標本・観察データの学名の命名コード | ICBN ICZN BC ICNCP BioCode ICZN; ICBN |
taxonomicStatus | 標本・観察データの学名の使用状況 | invalid misapplied homotypic synonym accepted |
nomenclaturalStatus | 学名命名法の状況 | nom. ambig. nom. illeg. nom. subnud. |
taxonRemarks | 生物分類名に関する補足情報 | this name is a misspelling in common use |